Protein–RNA interactions for Protein: P62330

ARF6, ADP-ribosylation factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARF6P62330 AC009053.1-204ENST00000429810 2355 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ANKRD11-203ENST00000378330 9132 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FAM13B-201ENST00000033079 5465 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 BX005266.2-201ENST00000450704 1549 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 JAKMIP3-201ENST00000298622 6626 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 DISC1-221ENST00000620189 6689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PEG13-201ENST00000631594 5667 ntBASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CMTR2-201ENST00000338099 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ABCA2-201ENST00000265662 8154 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 TET3-201ENST00000305799 5174 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 INSC-208ENST00000530161 1702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 POM121-201ENST00000358357 5320 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 UBE3A-204ENST00000438097 8939 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 UMODL1-204ENST00000400427 5442 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 GTF2I-215ENST00000614986 4415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 GTF2I-221ENST00000621734 4412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CEMIP-201ENST00000220244 7226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MYADML-201ENST00000474610 2147 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PAIP2-202ENST00000394795 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MICB-201ENST00000252229 2446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CSDC2-201ENST00000306149 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CDH1-201ENST00000261769 4889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MYO16-202ENST00000356711 6874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC007191.1-201ENST00000623179 2995 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MEX3B-201ENST00000329713 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 RHOC-206ENST00000369637 888 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AL162742.1-201ENST00000434792 954 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 Z97180.1-201ENST00000445173 988 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PENK-202ENST00000451791 1029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SDHD-202ENST00000525291 790 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC015689.1-201ENST00000525365 462 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AP002387.1-201ENST00000529369 680 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 NPLOC4-209ENST00000572760 946 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 IFITM3-204ENST00000602735 713 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 RPARP-AS1-202ENST00000492465 1556 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PRAMEF8-202ENST00000614831 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 AC006262.1-203ENST00000598170 1634 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PTPN23-201ENST00000265562 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FH-201ENST00000366560 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 ESRP2-202ENST00000473183 3793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
ARF6P62330 PXDN-201ENST00000252804 6808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
ARF6P62330 NHSL1-202ENST00000343505 6535 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.6 ms