Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 ARRB1-202ENST00000420843 3336 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TIGD6-201ENST00000296736 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DBN1-203ENST00000393565 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ADCY6-201ENST00000307885 6464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC4A7-211ENST00000445684 4061 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 BATF-201ENST00000286639 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MTHFSD-202ENST00000381214 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CD63-214ENST00000552692 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GIPC3-201ENST00000322315 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RGMA-204ENST00000543599 3174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 P2RY1-201ENST00000305097 6747 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZNF691-206ENST00000372508 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GIT2-201ENST00000320063 2094 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RIOK1-202ENST00000379834 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PTPN13-203ENST00000427191 8487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EIF4E2-201ENST00000258416 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FGFRL1-201ENST00000264748 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PSME3-203ENST00000541124 3366 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CLCN4-201ENST00000380829 2418 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SRP54-202ENST00000546080 2187 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NCBP2-204ENST00000427641 1946 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EIF4G3-204ENST00000374935 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ATP6V0A4-202ENST00000353492 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC39A8-203ENST00000424970 4032 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FXR1-214ENST00000480918 1996 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FZD6-206ENST00000523739 2774 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZNF609-202ENST00000416172 3863 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DAGLB-201ENST00000297056 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 REXO1L6P-201ENST00000603433 1515 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 YTHDF3-205ENST00000539294 5163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AP001062.1-201ENST00000448927 4354 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HIST1H1B-201ENST00000331442 681 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 VHLL-201ENST00000339922 676 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC52A1-203ENST00000512825 2989 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PLXNB3-209ENST00000538966 6377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 YIF1B-215ENST00000592246 936 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FAM66A-202ENST00000602658 546 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 LINC01114-203ENST00000425879 2434 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CELF1-201ENST00000310513 4583 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CR382287.2-201ENST00000623370 1942 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FAM109A-201ENST00000361483 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ADAMTS13-202ENST00000356589 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HADH-202ENST00000403312 1752 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TSPEAR-AS2-202ENST00000354333 2422 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AGRN-201ENST00000379370 7323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL031595.1-201ENST00000623969 4709 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CPNE5-202ENST00000393189 2542 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CD6-201ENST00000313421 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 WASHC2C-201ENST00000336378 4669 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 WWC2-201ENST00000403733 8826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ZDHHC8-201ENST00000320602 3072 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RFESD-201ENST00000311364 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 UBE2E2-202ENST00000396703 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DUSP23-202ENST00000368108 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.3 ms