Protein–RNA interactions for Protein: P55899

FCGRT, IgG receptor FcRn large subunit p51, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FCGRTP55899 OVOL3-202ENST00000633214 675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FCGRTP55899 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FCGRTP55899 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 PI4K2B-201ENST00000264864 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 INPP5D-201ENST00000359570 5274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 C7orf49-214ENST00000620897 1349 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 LRCH3-202ENST00000414675 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ACSS1-201ENST00000323482 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 JPT1-202ENST00000356033 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NFATC4-226ENST00000556279 2924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 MRPL35-201ENST00000254644 1061 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 FCN2-202ENST00000350339 943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 LINC01656-201ENST00000415702 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 EFNA4-203ENST00000427683 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 EEF1DP5-201ENST00000431410 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AL121787.1-202ENST00000445838 876 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ANKRD2-204ENST00000455090 1072 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 RPS18P9-201ENST00000482817 460 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 MIR2278-201ENST00000516344 96 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 URB1-AS1-201ENST00000534991 831 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 GABARAPL1-213ENST00000544284 531 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 RN7SL605P-201ENST00000577229 281 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 MIR4254-201ENST00000581063 76 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 OR2T11-201ENST00000625105 1072 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 RFX8-201ENST00000428343 1686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ARHGAP39-202ENST00000377307 4673 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TSHZ1-204ENST00000580243 3582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 DIDO1-201ENST00000266070 8574 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 PDHB-201ENST00000302746 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 IL18BP-205ENST00000393705 1549 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 CLEC18B-201ENST00000339953 1865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 CLEC18C-202ENST00000536907 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 COA6-203ENST00000366615 710 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AL161733.1-201ENST00000421067 462 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AL137244.1-201ENST00000422931 865 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ATXN8OS-202ENST00000424524 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
FCGRTP55899 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.4 ms