Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SPEG-205ENST00000396698 3379 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TJP3-202ENST00000541714 3350 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ABCA7-201ENST00000263094 6816 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TBC1D1-201ENST00000261439 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAD2L2-206ENST00000376672 1002 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 IGF2-201ENST00000381389 1023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC135178.1-201ENST00000458568 537 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RHEB-207ENST00000496004 744 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC011603.2-203ENST00000547387 897 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SLC35G2-201ENST00000393079 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 RGS3-208ENST00000394646 2716 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HACD2-201ENST00000383657 4257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ABAT-215ENST00000569156 1911 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 HTR7-202ENST00000336152 3126 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAGEA4-201ENST00000276344 1724 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZCCHC17-204ENST00000546109 1705 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 KCP-206ENST00000613019 4853 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 OSBPL5-203ENST00000389989 3619 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 PLXNB1-204ENST00000456774 5859 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 GPANK1-205ENST00000375906 2793 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 MAX-219ENST00000618858 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ACADSBP45954 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 CHIT1-201ENST00000255427 1598 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 BTNL8-205ENST00000505126 1294 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 AC091544.8-201ENST00000619490 361 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 APCDD1L-201ENST00000371149 3426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 RHD-209ENST00000568195 1467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ACADSBP45954 MCRS1-201ENST00000343810 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 LINC00667-206ENST00000582363 2935 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 ELOA2-202ENST00000620522 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ACADSBP45954 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms