Protein–RNA interactions for Protein: P34981

TRHR, Thyrotropin-releasing hormone receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 398 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRHRP34981 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 POLL-204ENST00000370168 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SFSWAP-201ENST00000261674 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ZNF576-201ENST00000336564 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 LINC00299-202ENST00000442956 2342 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ARMCX4-202ENST00000423738 7424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SF3B5-201ENST00000367569 693 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 KLF2P1-201ENST00000447438 1042 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 HLA-J-204ENST00000495278 958 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC104241.2-201ENST00000532748 789 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SNORD3B-2-202ENST00000571722 791 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RPS5-209ENST00000601521 1203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL137026.1-201ENST00000624407 503 ntTSL 4 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC104836.1-202ENST00000636805 6041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 TRIM45-202ENST00000369461 2415 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RILPL1-202ENST00000376874 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 HSPA8P5-201ENST00000456928 2069 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ATL2-210ENST00000452935 2199 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 PEX5L-211ENST00000472994 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RGMA-202ENST00000425933 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 C17orf53-201ENST00000245382 2272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ABHD18-206ENST00000611882 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 KLF11-205ENST00000535335 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SMPDL3B-201ENST00000373888 1548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AATBC-201ENST00000400385 4598 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL354893.2-201ENST00000423075 529 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC026740.1-201ENST00000607068 791 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ZNF607-201ENST00000355202 4364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 IL17RD-208ENST00000640796 2345 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 IL20RA-201ENST00000316649 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 TEX44-201ENST00000313965 1383 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 PDPK1-201ENST00000268673 4728 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 FGF12-207ENST00000454309 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ANKRD42-201ENST00000260047 2514 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 ALOX15-201ENST00000293761 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 CSRP1-202ENST00000367306 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 AL589669.1-201ENST00000639829 1506 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
TRHRP34981 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms