Protein–RNA interactions for Protein: P32456

GBP2, Guanylate-binding protein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 591 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBP2P32456 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AP000438.1-201ENST00000543624 749 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 RN7SL574P-201ENST00000581512 297 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 SRD5A3-AS1-211ENST00000599135 737 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 C20orf141-202ENST00000603872 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AC138466.3-201ENST00000619983 221 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AC022748.3-201ENST00000621828 275 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 DSN1-203ENST00000373750 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 PVR-202ENST00000344956 3166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 MTMR3-204ENST00000401950 6018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
GBP2P32456 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PPFIBP1-216ENST00000545334 2805 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CSNK1D-202ENST00000314028 3712 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 DDIAS-203ENST00000525361 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZNF717-204ENST00000478296 3875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 KDM2B-202ENST00000377071 4595 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NOX5-204ENST00000455873 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
GBP2P32456 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TMEM198B-201ENST00000471276 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TMEM245-201ENST00000374586 7980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SEPT7-202ENST00000399034 4399 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 WNT9B-202ENST00000393461 2654 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 IKZF1-204ENST00000349824 5757 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MRPS17-201ENST00000285298 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RAB40AL-201ENST00000218249 1029 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 KLK8-204ENST00000391806 1051 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ARMCX3-AS1-201ENST00000454228 490 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SON-203ENST00000381679 7860 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 RPA3-201ENST00000223129 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SEMA3F-202ENST00000413852 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ADAM33-206ENST00000617732 1971 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ESRRB-207ENST00000556177 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 AL139385.1-201ENST00000611744 3272 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 SCUBE2-201ENST00000309263 3727 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 REV3L-207ENST00000435970 10943 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
GBP2P32456 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP2P32456 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP2P32456 XPR1-201ENST00000367589 4126 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP2P32456 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
GBP2P32456 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms