Protein–RNA interactions for Protein: P28358

HOXD10, Homeobox protein Hox-D10, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD10P28358 MED19-202ENST00000431606 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 STAG3L3-203ENST00000436857 1033 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC103923.1-201ENST00000453229 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC025594.1-201ENST00000469533 543 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SOX2-OT-209ENST00000485035 561 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 ALG1L7P-201ENST00000502317 768 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 C5orf63-203ENST00000509733 553 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC104590.1-201ENST00000560813 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SOX2-OT-222ENST00000595084 853 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 SOX2-OT-232ENST00000600386 792 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC079779.4-201ENST00000619113 548 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC048382.6-201ENST00000621980 1223 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC020904.3-201ENST00000624199 442 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 AL662899.1-201ENST00000461287 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CHRNA2-201ENST00000240132 1735 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
HOXD10P28358 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TGFBR2-201ENST00000295754 4621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 C1orf87-202ENST00000450089 1307 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TBC1D3P2-201ENST00000339120 1513 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 EXOC3L1-201ENST00000314586 2510 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SPRYD7-202ENST00000378195 3086 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CIART-201ENST00000290363 1746 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IFNLR1-203ENST00000374418 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PRAME-206ENST00000406503 740 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 IFITM1-202ENST00000408968 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 RPL3P2-204ENST00000413027 1203 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 Z82188.2-201ENST00000419128 630 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL137026.2-201ENST00000437014 841 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 AL451069.3-201ENST00000450206 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GSS-202ENST00000451957 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC145422.1-201ENST00000541574 544 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 CDIPT-AS1-202ENST00000565014 729 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ETV4-208ENST00000586826 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC012593.1-214ENST00000586952 767 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 ZFP36-201ENST00000594045 690 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 PRAMEF7-202ENST00000616979 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
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HOXD10P28358 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 CTDSP1-201ENST00000273062 2638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 FAM9B-201ENST00000327220 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PAK1-201ENST00000278568 2543 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 GAPDH-204ENST00000396859 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 HNRNPA1P21-201ENST00000424115 961 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 PEBP1P3-201ENST00000455475 548 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AL445471.1-201ENST00000456316 820 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 TMEM14B-215ENST00000481240 1032 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC147876.1-201ENST00000504408 322 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AC113347.2-201ENST00000512350 279 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 FXYD6-208ENST00000529335 708 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HOXD10P28358 AP004550.1-201ENST00000532652 514 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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