Protein–RNA interactions for Protein: P28070

PSMB4, Proteasome subunit beta type-4, humanhuman

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Length 264 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB4P28070 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PATL2-201ENST00000434130 1950 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MTX1P1-201ENST00000440904 838 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AL451067.1-201ENST00000453111 394 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 USB1-203ENST00000539737 1212 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC012568.1-201ENST00000558463 472 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AP005264.1-201ENST00000586226 733 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC017083.2-201ENST00000608069 979 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PCDHGB7-201ENST00000398594 4765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ATRIP-204ENST00000412052 2721 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AL928654.5-201ENST00000624831 2501 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 IL1RN-201ENST00000259206 1810 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CETP-203ENST00000566128 1733 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 UBTF-205ENST00000526094 2459 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CACNA1I-203ENST00000404898 9892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC008429.1-202ENST00000518818 2067 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MINDY4-201ENST00000265299 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 KIAA0319-201ENST00000378214 6802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ANKMY1-208ENST00000405002 3304 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TRIM17-203ENST00000366697 2652 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FGR-204ENST00000399173 2483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 UPK3A-201ENST00000216211 1051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TEX29-201ENST00000283547 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 BX284668.5-201ENST00000422124 406 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 EPDR1-203ENST00000425345 947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MIR663AHG-201ENST00000427348 1213 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 BNIP3P42-201ENST00000454982 569 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 BNIP3P29-201ENST00000598302 571 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AC011447.5-201ENST00000616168 564 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 FAM129B-202ENST00000373314 3760 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 TMEM30B-202ENST00000555868 4471 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 SLFNL1-204ENST00000372613 2654 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 KLHL13-207ENST00000540167 3396 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 PPM1M-203ENST00000409502 1790 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 MSL2-201ENST00000309993 4692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ADAM33-207ENST00000619289 3195 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 ANO10-202ENST00000350459 2039 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
PSMB4P28070 HIST3H2BB-201ENST00000620438 2364 ntAPPRIS P1 BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 HS3ST5-201ENST00000312719 3901 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 FLAD1-206ENST00000368432 1839 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ZNF596-201ENST00000308811 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ANGPTL2-202ENST00000373425 3707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 DLL4-201ENST00000249749 3372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
PSMB4P28070 ATE1-202ENST00000369040 4803 ntTSL 2 BASIC14.64□□□□□ -0.07
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