Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 TTC8-203ENST00000346301 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PELP1-212ENST00000574876 3465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PBXIP1-202ENST00000368463 3212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 FRMD5-201ENST00000402883 4091 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LRRFIP1-203ENST00000308482 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 WASHC2A-202ENST00000314664 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
SCP2P22307 FAM76A-203ENST00000373949 2273 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 GRIN2C-201ENST00000293190 4261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PRIMPOL-211ENST00000515774 2007 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ACTN2-206ENST00000542672 4906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PLA1A-204ENST00000488919 1456 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 GDF9-201ENST00000296875 1796 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ERVK13-1-207ENST00000569465 3321 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DYRK1B-202ENST00000348817 2448 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SLC19A2-201ENST00000236137 3671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 MED12L-203ENST00000422248 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 POLR2E-213ENST00000615234 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ZBTB7B-207ENST00000535420 3777 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ARF5-201ENST00000000233 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 YIPF7-201ENST00000332990 937 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DUSP13-202ENST00000372700 781 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 C1orf159-201ENST00000379319 1097 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC117500.3-201ENST00000537032 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC026495.1-203ENST00000557528 906 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC011447.3-201ENST00000590606 722 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 NDRG4-217ENST00000562999 2931 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PALD1-201ENST00000263563 4555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CYP1B1-205ENST00000610745 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 NIT1-203ENST00000368009 1362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 FBXL21-202ENST00000467490 1742 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ALDOA-203ENST00000395248 2447 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SLC4A11-202ENST00000380059 3229 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DNAJB6-201ENST00000262177 2527 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DLG4-203ENST00000399510 3975 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
SCP2P22307 TAF8-203ENST00000372982 1805 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ABCG1-205ENST00000398449 2998 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CTXND1-201ENST00000560778 6890 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 KRTAP20-4-201ENST00000382828 224 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 COPS7B-205ENST00000409295 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC016825.1-201ENST00000433600 778 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CPLX2-209ENST00000515094 576 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AL512310.5-201ENST00000551999 515 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 TSR1-204ENST00000576112 1290 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SKA2-205ENST00000580541 689 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 MIR6787-201ENST00000616675 61 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 AC092299.1-201ENST00000632679 757 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 ARHGAP10-201ENST00000336498 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 C16orf45-202ENST00000452191 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
SCP2P22307 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91 ms