Protein–RNA interactions for Protein: P0DMR3

ATXN8OS, Putative protein ATXN8OS, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATXN8OSP0DMR3 NPM1P9-201ENST00000453156 844 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MTCO2P18-201ENST00000457151 658 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RAD51D-205ENST00000460118 1064 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RPL5P11-201ENST00000498068 893 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC008427.1-201ENST00000503102 655 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01339-201ENST00000505712 440 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC111000.2-201ENST00000507775 550 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC006063.1-201ENST00000512511 560 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MTATP6P1-201ENST00000514057 681 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 POLD4-211ENST00000539074 714 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GLTP-205ENST00000544393 914 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CR383656.11-201ENST00000552261 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PSMA4-219ENST00000560217 944 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NAA38-207ENST00000576861 556 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 BNIP3P13-201ENST00000599968 566 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC004080.4-201ENST00000602610 633 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC098590.2-201ENST00000614787 281 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL603755.1-201ENST00000619504 163 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC131159.1-201ENST00000621854 213 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OR10J1-202ENST00000641630 1089 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF664-204ENST00000538932 4321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CSF2RA-219ENST00000501036 1622 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC139713.2-209ENST00000509873 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MPLKIP-201ENST00000306984 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 WSCD2-206ENST00000547525 4481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC02476-201ENST00000426413 1577 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ATP2B3-201ENST00000263519 6420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ADRB1-201ENST00000369295 2853 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 GUCA1C-201ENST00000261047 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 JTB-201ENST00000271843 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OR4C3-201ENST00000319856 1036 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TRNT1-203ENST00000339437 976 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RETN-202ENST00000381324 249 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 HNRNPA3P3-201ENST00000416838 1137 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL121753.1-201ENST00000444717 529 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01201-202ENST00000451431 401 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AL391704.1-202ENST00000453889 874 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC079910.1-201ENST00000477099 749 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TMEM176B-206ENST00000492607 1265 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 RPF2P2-201ENST00000504693 896 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AP001207.2-201ENST00000519490 539 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 VN1R46P-201ENST00000519939 850 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OR5M11-201ENST00000528616 1020 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC007406.4-201ENST00000539568 765 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC02544-201ENST00000564830 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 SECTM1-202ENST00000580437 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 ZNF415P1-201ENST00000582279 1166 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 OR4C3-203ENST00000641889 990 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 LINC01583-202ENST00000558082 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 AC067942.1-201ENST00000488045 1493 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
ATXN8OSP0DMR3 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms