Protein–RNA interactions for Protein: P09629

HOXB7, Homeobox protein Hox-B7, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB7P09629 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 TPD52L2-202ENST00000346249 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 IQCE-216ENST00000611775 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ILDR1-205ENST00000462014 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC083949.1-201ENST00000422013 657 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 GS1-124K5.4-201ENST00000445681 540 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 IGHV1-12-201ENST00000518307 205 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 SOCS2-AS1-204ENST00000551626 618 ntTSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 LINC01543-201ENST00000578367 900 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AC008758.6-201ENST00000598753 588 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 AP003419.4-201ENST00000616071 517 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 GFI1B-207ENST00000636137 1870 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 COL27A1-201ENST00000356083 7790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
HOXB7P09629 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GOLGA8EP-201ENST00000530246 1959 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TMBIM6-217ENST00000549385 2771 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SLC26A8-201ENST00000355574 3463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 NUMB-216ENST00000555394 3037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CDCA7-203ENST00000410019 1488 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TAOK3-201ENST00000392533 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DYDC2-204ENST00000372199 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AIFM2-204ENST00000613322 3247 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL109767.1-201ENST00000429450 564 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC034231.1-201ENST00000507251 537 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 C12orf73-210ENST00000552940 685 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 GAS7-216ENST00000583882 553 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 BCL2L11-219ENST00000619294 5132 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF362-205ENST00000539719 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RNF11-201ENST00000242719 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TMEM145-203ENST00000598766 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC061965.1-201ENST00000560524 1465 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RHOG-201ENST00000351018 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 MYH14-203ENST00000425460 6811 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 RHPN1-201ENST00000289013 3683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AK2P2-201ENST00000439142 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC253536.4-201ENST00000440539 267 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CSAG1-204ENST00000452779 627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CD81-209ENST00000492627 886 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 STAT5A-208ENST00000587646 1022 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC011500.3-201ENST00000594676 647 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AL359091.4-201ENST00000610052 409 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC105137.3-201ENST00000617588 984 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 DSG1-202ENST00000462981 1857 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ALDOA-204ENST00000412304 1603 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 AC090502.4-201ENST00000551714 1386 ntBASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
HOXB7P09629 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.8 ms