Protein–RNA interactions for Protein: P00736

C1R, Complement C1r subcomponent, humanhuman

Predictions only

Length 705 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1RP00736 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AQP8-202ENST00000566125 1276 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC137723.1-201ENST00000584705 709 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC025048.2-201ENST00000590744 786 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC005041.3-201ENST00000606287 649 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 SLC12A5-219ENST00000628272 401 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 MX1-218ENST00000619682 1980 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 DDX56-201ENST00000258772 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 SOCS5-202ENST00000394861 4058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
C1RP00736 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ANKMY1-210ENST00000406958 2396 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ANKRD33B-201ENST00000296657 9188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 TMSB15A-201ENST00000289373 685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 VEGFB-202ENST00000426086 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 APOPT1-209ENST00000492189 513 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 AC091179.2-201ENST00000495536 532 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 CR383656.3-201ENST00000551315 183 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 NPTN-204ENST00000562924 1094 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ZNF790-AS1-203ENST00000588906 850 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 ATG5-201ENST00000343245 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 PYGM-202ENST00000377432 2611 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1RP00736 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 RPTOR-202ENST00000544334 5734 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 API5-208ENST00000531273 1868 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1RP00736 AFF3-203ENST00000409579 4342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 UBE3B-202ENST00000342494 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 BBS1-225ENST00000630659 1934 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AK1-202ENST00000373156 757 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AC018814.1-201ENST00000418972 357 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 TRPM2-AS-201ENST00000423310 586 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 PSMD4P1-201ENST00000433951 1109 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 AC022858.1-201ENST00000521685 685 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1RP00736 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.8 ms