Protein–RNA interactions for Protein: O43909

EXTL3, Exostosin-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EXTL3O43909 UHRF1BP1L-201ENST00000279907 5168 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CAMKV-202ENST00000463537 2818 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SRRT-217ENST00000618411 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KRTAP19-9P-201ENST00000421795 191 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 POLRMT-202ENST00000588649 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC010323.1-201ENST00000598884 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PEX26-205ENST00000610387 3924 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CRLS1-201ENST00000378863 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC00115-201ENST00000473798 1317 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TMEM106A-202ENST00000541594 1330 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PUF60-209ENST00000527197 1559 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DDX17-202ENST00000396821 4791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NOC2L-201ENST00000327044 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TDRD12-202ENST00000444215 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RET-201ENST00000340058 4149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ELN-203ENST00000320492 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ANKRD13B-201ENST00000394859 3214 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TGOLN2-204ENST00000409015 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CDH20-201ENST00000262717 3882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 APBB1-203ENST00000389906 2684 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NUCB1-201ENST00000405315 2668 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CPEB2-205ENST00000442003 6797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NID1-201ENST00000264187 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RPP25L-202ENST00000378959 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MEMO1-204ENST00000407893 682 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SF3B1-204ENST00000414963 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC106786.1-201ENST00000442777 792 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RN7SL11P-201ENST00000471305 293 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TSHR-205ENST00000554263 1184 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 TSHR-206ENST00000554435 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 IGFLR1-211ENST00000592889 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01278-203ENST00000608788 820 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 LINC01278-207ENST00000610234 555 ntTSL 4 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 BAP1-211ENST00000615113 489 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 MAGI1-201ENST00000330909 7415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RAD23A-209ENST00000592268 1526 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 RARS2-201ENST00000369536 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 COQ7-209ENST00000569127 2575 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PAX8-AS1-204ENST00000436293 2687 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
EXTL3O43909 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms