Protein–RNA interactions for Protein: A8MYP8

ODF3B, Outer dense fiber protein 3B, humanhuman

Predictions only

Length 253 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3BA8MYP8 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 NELFE-201ENST00000375425 1405 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ANKRD36BP2-202ENST00000421951 1899 ntTSL 3 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ZNF133-203ENST00000377671 2701 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CAMK1D-204ENST00000619168 8153 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LARGE1-201ENST00000354992 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LILRA2-203ENST00000391737 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.51□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MFAP4-202ENST00000395592 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 NF2-205ENST00000361452 5884 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 BBS2-201ENST00000245157 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TADA3-204ENST00000440161 1617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PSMG2-201ENST00000317615 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MPP6-201ENST00000222644 8452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ZFPM2-201ENST00000407775 4700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MST1P2-201ENST00000457982 2291 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AL157996.1-201ENST00000624684 2299 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 IL17B-201ENST00000261796 696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 DPCD-202ENST00000370151 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 Z82214.1-201ENST00000419643 988 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RPS27L-203ENST00000439025 970 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC234782.1-201ENST00000451950 919 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LINC02435-201ENST00000508291 584 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC005740.1-201ENST00000515639 522 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PCMTD1-207ENST00000522514 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LINC02205-201ENST00000559752 239 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 NDUFB10P1-201ENST00000567319 521 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC115099.1-201ENST00000570413 362 ntTSL 3 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RN7SL455P-201ENST00000580629 282 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SNHG25-202ENST00000582965 278 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 EAF1-AS1-208ENST00000608408 770 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SFTA2-203ENST00000634371 815 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 POTEM-201ENST00000547889 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ECE1-201ENST00000264205 2381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SLC30A5-209ENST00000621204 3999 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AC004997.1-205ENST00000447976 1851 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ALK-201ENST00000389048 6220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CAP2P1-201ENST00000557743 1390 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CAMK2D-205ENST00000394524 5294 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CACTIN-203ENST00000429344 3612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LINC00475-202ENST00000416438 2506 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AUTS2-218ENST00000615871 4511 ntTSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SLC37A4-201ENST00000330775 2102 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC11.5□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PPP6R1-203ENST00000587283 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TBL3-208ENST00000615855 2472 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 TAF4B-203ENST00000578121 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 OPN5-202ENST00000371211 1801 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ZNF829-201ENST00000391711 1805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 ZBTB7C-213ENST00000588982 4949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 AP002990.1-202ENST00000496634 5064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 GPR132-203ENST00000539291 2779 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
ODF3BA8MYP8 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.49□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms