Protein–RNA interactions for Protein: V9GYD0

ARL2-SNX15, ARL2-SNX15 readthrough (NMD candidate), humanhuman

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL2-SNX15V9GYD0 CRISPLD2-209ENST00000567845 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SYMPK-201ENST00000245934 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ERAS-201ENST00000338270 1266 ntAPPRIS P1 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TBC1D7-201ENST00000343141 1027 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ESPNP-202ENST00000414828 571 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM135-209ENST00000532959 1149 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 C3orf18-206ENST00000449241 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AFAP1-203ENST00000382543 2590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 APOBEC3A-202ENST00000402255 1478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TRUB2-201ENST00000372890 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TOR1AIP1-212ENST00000606911 8704 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CYB5RL-201ENST00000287899 5777 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 CDK5RAP3-201ENST00000338399 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RCBTB2-205ENST00000544492 2622 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RERE-212ENST00000476556 4598 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 COL6A1-207ENST00000612273 3251 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 POLG-202ENST00000442287 4487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ETS2-201ENST00000360214 3936 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TUBGCP2-210ENST00000543663 4302 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ATP2C2-AS1-201ENST00000565700 2998 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 STAT4-202ENST00000392320 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TNIP3-201ENST00000057513 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 ATP11A-201ENST00000375630 8768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SYNE3-201ENST00000334258 3275 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 FUT8-202ENST00000358307 2664 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NCSTN-201ENST00000294785 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CASC4-201ENST00000299957 3962 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
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ARL2-SNX15V9GYD0 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ITPRIPL1-204ENST00000439118 1946 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TOLLIP-203ENST00000525159 3429 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF23-203ENST00000393539 3242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 SFRP1-202ENST00000379845 3873 ntTSL 2 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 RUFY4-201ENST00000344321 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 ZNF785-201ENST00000395216 3282 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MYO1D-202ENST00000394649 5451 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PRKD1-201ENST00000331968 3726 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL021395.1-201ENST00000611791 2232 ntTSL 5 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AAR2-202ENST00000373932 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MAGEL2-201ENST00000532292 4298 ntAPPRIS P1 BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC11.28□□□□□ -0.6
ARL2-SNX15V9GYD0 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC11.28□□□□□ -0.6
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