Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3A2

UTP11, Probable U3 small nucleolar RNA-associated protein 11, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP11Q9Y3A2 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AP000911.1-202ENST00000532706 543 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PIGH-209ENST00000559581 1049 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AP001033.1-201ENST00000584509 466 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 METTL26-214ENST00000614890 801 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HYOU1-219ENST00000614711 3057 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MLXIP-208ENST00000538698 5097 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GRK3-201ENST00000324198 9103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PFKP-203ENST00000381125 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PTK2-202ENST00000395218 4415 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 LDLRAD2-201ENST00000344642 4012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GRWD1-201ENST00000253237 5571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 BHLHE40-AS1-204ENST00000620618 2355 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CNN2-202ENST00000348419 2033 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 KIF12-201ENST00000374118 2001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NGEF-201ENST00000264051 3215 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 WDR66-201ENST00000288912 4467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 POMK-201ENST00000331373 1865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC082651.4-201ENST00000483023 1852 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 DLGAP1-205ENST00000400150 5332 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CAMKV-201ENST00000296471 2913 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SLC1A6-201ENST00000221742 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 USF1-202ENST00000368020 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PI4KB-203ENST00000368874 3934 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZBTB47-201ENST00000232974 3781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SPOCD1-201ENST00000257100 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SEMA6D-208ENST00000558014 6028 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HNRNPA1P48-201ENST00000562726 1377 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HECTD2-201ENST00000298068 4802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MAP2K4-201ENST00000353533 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CYP51A1-AS1-201ENST00000453068 2957 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 RASA3-IT1-201ENST00000454005 380 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZBED6CL-201ENST00000343855 2933 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 COL6A3-202ENST00000347401 8625 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 COL6A3-209ENST00000472056 8628 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC093899.2-201ENST00000513963 1935 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CHEK2-201ENST00000328354 1867 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 FP325330.2-201ENST00000624219 5630 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PCDHB18P-202ENST00000526308 3197 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZNF341-202ENST00000375200 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 DUOX2-205ENST00000603300 6345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CACNA1G-233ENST00000515765 6981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TNFRSF11A-201ENST00000269485 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 PATL2-207ENST00000560775 1913 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NCLN-201ENST00000246117 4005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 TMEM25-204ENST00000359862 2395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 GALC-201ENST00000261304 3883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 C9orf3-202ENST00000297979 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
UTP11Q9Y3A2 NCOR2-208ENST00000429285 8475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.7 ms