Protein–RNA interactions for Protein: Q9UNS2

COPS3, COP9 signalosome complex subunit 3, humanhuman

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Length 423 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS3Q9UNS2 NAP1L2-201ENST00000373517 2550 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SFI1-229ENST00000540643 4226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 KIAA1161-201ENST00000297625 6398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 UBE3A-209ENST00000625778 3217 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PLXNB2-201ENST00000359337 6335 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PARP1-203ENST00000366794 3958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 HSD17B4-201ENST00000256216 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 DCHS1-201ENST00000299441 10765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PP14571-202ENST00000404891 2017 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 TOM1L2-214ENST00000581396 5595 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ARMC5-201ENST00000268314 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SDC2-201ENST00000302190 3759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 KIF3A-201ENST00000378735 3266 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 GRIK4-202ENST00000438375 4214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 FAM149A-203ENST00000389354 1815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 IL12RB1-203ENST00000593993 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 OSBPL5-201ENST00000263650 3889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ZCCHC18-206ENST00000611638 2941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RAB40A-201ENST00000304236 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ASH2L-201ENST00000343823 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SMARCA4-202ENST00000413806 5512 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PGBD2-202ENST00000355360 2879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SF1-205ENST00000377394 2854 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SLC22A20-202ENST00000525437 3196 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RGS6-217ENST00000555571 1764 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 IGF2-203ENST00000381395 4527 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 HGNC:18790-201ENST00000397958 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 TMEM201-201ENST00000340305 3851 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 WASHC2C-210ENST00000623400 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SLC25A2-201ENST00000239451 1417 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 IL1RL2-201ENST00000264257 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PDZK1IP1-201ENST00000294338 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RNF26-201ENST00000311413 2787 ntAPPRIS P1 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PSIP1-203ENST00000380733 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PABPN1L-202ENST00000419291 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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COPS3Q9UNS2 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 OST4-202ENST00000447619 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CDK3-202ENST00000448471 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CPEB4-208ENST00000520867 2607 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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COPS3Q9UNS2 IL32-218ENST00000530890 774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC026471.2-201ENST00000569782 655 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 REC8-213ENST00000620473 2405 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ZNF135-205ENST00000511556 2253 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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COPS3Q9UNS2 PGA5-201ENST00000312403 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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COPS3Q9UNS2 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 BORCS5-202ENST00000314565 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
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COPS3Q9UNS2 PPT2-245ENST00000361568 1759 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CD276-202ENST00000318443 3469 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SERTAD2-201ENST00000313349 5549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 EMC10-201ENST00000334976 9446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 GRHL1-202ENST00000405379 1881 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 BCKDHB-201ENST00000320393 3692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SEMA7A-202ENST00000542748 3228 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CRYBG1-201ENST00000369066 7553 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ATP2B2-210ENST00000638646 3465 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PPP2R1A-201ENST00000322088 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 APBB2-211ENST00000506352 3316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 AFDN-211ENST00000447894 5475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 ZNF641-201ENST00000301042 4544 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 CLOCK-211ENST00000513440 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
COPS3Q9UNS2 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
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