Protein–RNA interactions for Protein: Q9NT22

EMILIN3, EMILIN-3, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMILIN3Q9NT22 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FAM149A-202ENST00000356371 2997 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 EDNRB-204ENST00000626030 1571 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FHL2-206ENST00000408995 1367 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ACP2-212ENST00000533929 1366 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CRIP3-202ENST00000372569 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 GEMIN7-202ENST00000391951 716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AL008733.1-201ENST00000440516 469 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 HTR4-207ENST00000520514 1236 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 WDYHV1-206ENST00000523356 869 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC138701.2-201ENST00000553634 226 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MAFTRR-203ENST00000567993 685 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 UPF3AP2-202ENST00000578315 730 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FGD2-201ENST00000274963 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MRM2-201ENST00000242257 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PRF1-201ENST00000373209 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 BFAR-203ENST00000562442 1414 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 LINC01815-202ENST00000641468 1409 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 TEX264-201ENST00000341333 1340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CAPN5-202ENST00000456580 2805 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PRKD2-201ENST00000291281 3070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PMM2-201ENST00000268261 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MYLK2-202ENST00000375994 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 OPRM1-201ENST00000229768 1465 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 OPRM1-207ENST00000428397 1481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PON3-201ENST00000265627 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC084030.1-201ENST00000455068 561 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 TXNRD2-206ENST00000462330 1129 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 SLC14A1-206ENST00000535474 1048 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC090825.1-202ENST00000560059 665 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC005828.3-201ENST00000583552 591 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC127024.7-201ENST00000625101 200 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 UBC-205ENST00000536769 3745 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AGGF1P1-201ENST00000509500 2073 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CDC42EP4-202ENST00000439510 2879 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 COLCA2-202ENST00000526216 1332 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 MKRN2-201ENST00000170447 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 ABLIM2-209ENST00000505872 1680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 PLAT-205ENST00000519510 2030 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
EMILIN3Q9NT22 LRRIQ3-203ENST00000370911 1591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms