Protein–RNA interactions for Protein: Q9C0F1

CEP44, Centrosomal protein of 44 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 390 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP44Q9C0F1 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 WDR59-201ENST00000262144 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C3orf33-205ENST00000534941 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 WARS-203ENST00000358655 2466 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SPRY4-202ENST00000434127 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RN7SL832P-201ENST00000607781 1756 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CCNA1-204ENST00000630422 1751 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PORCN-204ENST00000361988 1672 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC00334-203ENST00000638500 1377 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PURA-201ENST00000331327 11497 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KRTAP19-7-201ENST00000334849 440 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AP1B1P1-201ENST00000432373 827 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC005234.1-201ENST00000457851 434 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC012618.1-201ENST00000461223 412 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 INHBA-205ENST00000638023 2002 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ARMCX6-208ENST00000539247 1928 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CYP20A1-203ENST00000429815 1812 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SLC39A14-201ENST00000240095 1708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BSDC1-205ENST00000446293 1505 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RAF1-201ENST00000251849 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FRMPD2B-201ENST00000431305 1347 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PHF3-209ENST00000509330 2969 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PRICKLE1-201ENST00000345127 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SUPT4H1-201ENST00000225504 1489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 EWSR1-204ENST00000333395 1265 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC114488.1-201ENST00000435872 591 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 HVCN1-203ENST00000439744 1215 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC104561.3-201ENST00000518590 715 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BCAT2-203ENST00000545387 1272 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 CEP131-203ENST00000450824 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 LINC00339-208ENST00000634934 1518 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FCHO1-206ENST00000594202 3214 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 SLC25A35-201ENST00000380067 2785 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PHF24-201ENST00000242315 5718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MGRN1-202ENST00000399577 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 FP565260.6-203ENST00000620015 1435 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
CEP44Q9C0F1 PDE8B-203ENST00000340978 3426 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
CEP44Q9C0F1 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms