Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 HSPA4L-204ENST00000508776 3020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EIF4G1-202ENST00000346169 5516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LCN6-201ENST00000341206 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CLCC1-202ENST00000348264 1124 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TPM3-211ENST00000368531 1115 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PGAM1P11-201ENST00000416729 680 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 IQCF4-202ENST00000422896 745 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 IFNWP2-201ENST00000431203 580 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P2-207ENST00000432375 960 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KRT18P62-201ENST00000446618 1287 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HNRNPA1P56-201ENST00000505767 954 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 BCL2L12P1-201ENST00000508390 733 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SORD2P-201ENST00000558556 1069 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PRICKLE3-204ENST00000453382 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 YY1AP1-201ENST00000295566 2626 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EIF4G3-205ENST00000400422 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PAX6-264ENST00000640125 1375 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CCT4-201ENST00000394440 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 APBB3-202ENST00000356738 1804 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FAM163B-201ENST00000356873 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PLA2G12B-201ENST00000373032 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 IGHV1-3-201ENST00000390595 395 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 OR10N1P-201ENST00000392758 869 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FAM21EP-201ENST00000417804 985 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AL132657.1-201ENST00000432530 712 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NRADDP-201ENST00000437305 691 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC027612.2-202ENST00000445955 1199 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC090152.1-203ENST00000517898 1106 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LZTS1-AS1-201ENST00000523103 892 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC087203.1-201ENST00000532111 1181 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC074050.2-201ENST00000563338 538 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 RN7SL556P-201ENST00000582856 298 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FAM32A-204ENST00000588367 798 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TYMSP2-201ENST00000589501 424 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 KXD1-211ENST00000599319 707 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC016586.1-201ENST00000600056 684 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AL451165.2-201ENST00000606971 718 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 GGNBP1-204ENST00000613113 887 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 Metazoa_SRP.144-201ENST00000617007 311 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PSMA6-215ENST00000622405 978 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC005274.1-201ENST00000623460 802 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LRRFIP1-201ENST00000244815 4370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HERPUD1-202ENST00000344114 1388 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC138761.6-201ENST00000583997 1423 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 HTR3D-201ENST00000334128 1459 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NFATC1-218ENST00000592223 2531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 UBE2L5P-202ENST00000635918 1513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 FAM214B-202ENST00000378557 3070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 PDE4C-204ENST00000539010 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 INTS11-248ENST00000545578 2263 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 SLC25A31-201ENST00000281154 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FOXQ1Q9C009 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms