Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWW8

APOL6, Apolipoprotein L6, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOL6Q9BWW8 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 KCTD3-201ENST00000259154 3931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 SFMBT1-201ENST00000394752 4548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 PCBP2-215ENST00000549863 1619 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 P2RX5-207ENST00000551178 1863 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
APOL6Q9BWW8 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SEPT9-244ENST00000592420 2588 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 EXTL1-201ENST00000374280 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SLC52A3-205ENST00000632431 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AP002353.1-201ENST00000528257 1599 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 GCKR-201ENST00000264717 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AC082651.3-201ENST00000474667 1947 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FLII-201ENST00000327031 4338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 NIPAL3-202ENST00000339255 1676 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 BTBD8-201ENST00000342818 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SLC26A11-203ENST00000546047 2807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC01648-201ENST00000445180 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC00513-201ENST00000447430 1616 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 OR9I1-201ENST00000302610 945 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 GSG1L-201ENST00000380897 1173 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AL583805.1-201ENST00000391389 531 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AP000356.1-201ENST00000438893 364 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FTLP1-201ENST00000449155 526 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 RN7SL530P-201ENST00000485097 298 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ZNF124-204ENST00000491356 956 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 CFL1-214ENST00000534769 758 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 MSRB3-206ENST00000535664 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC02417-201ENST00000542449 515 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 GOLGA2P7-207ENST00000559668 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 B3GAT2-201ENST00000230053 6565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 CRYBG2-210ENST00000527815 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 NMBR-201ENST00000258042 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PBX3-203ENST00000373487 2902 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TCAF1-205ENST00000479870 5733 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC00963-203ENST00000423918 1654 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ZNF587-203ENST00000423137 1974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TGM6-201ENST00000202625 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 TMEM144-209ENST00000509278 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SMTNL1-202ENST00000527972 1649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 STRADA-243ENST00000640086 1925 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ERC1-219ENST00000546231 4390 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 PBDC1-201ENST00000373357 977 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 LCMT1-202ENST00000380966 989 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AL627231.1-201ENST00000394467 1125 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
APOL6Q9BWW8 AL080250.1-201ENST00000438676 445 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.3 ms