Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 COQ3-201ENST00000254759 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TNFRSF10C-201ENST00000356864 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 EPHA5-202ENST00000354839 3427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 NHP2-202ENST00000314397 599 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CUTA-203ENST00000374500 937 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC006529.1-201ENST00000459978 637 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CYB561A3-208ENST00000536915 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AP001029.1-201ENST00000589843 168 ntTSL 3 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 COQ4-204ENST00000608951 781 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC244250.3-201ENST00000620749 366 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MIR6746-201ENST00000620971 63 ntBASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 OSMR-AS1-204ENST00000636516 850 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CPEB2-201ENST00000259997 5612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.66□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ABAT-203ENST00000425191 1923 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CAB39L-204ENST00000409130 1411 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MIER1-202ENST00000355977 3595 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PAPSS2-201ENST00000361175 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PPOX-201ENST00000352210 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IQCJ-201ENST00000397832 1460 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TOM1L2-202ENST00000379504 2418 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 KCTD10-208ENST00000540089 3096 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MANEA-202ENST00000369293 1076 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FTCDNL1-203ENST00000420922 772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC00211-203ENST00000446799 662 ntTSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SNHG14-209ENST00000456576 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SOX2-OT-208ENST00000477928 902 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 BRSK1-203ENST00000585418 1104 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SNRPA1-216ENST00000626000 539 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AL121956.4-201ENST00000629925 581 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 MMP25-201ENST00000336577 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 LINC00905-203ENST00000588838 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 IL20RA-203ENST00000367748 3522 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 SSTR5-AS1-204ENST00000569832 2864 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 FBXL7-203ENST00000510662 1758 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 AC022400.6-201ENST00000603027 5818 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ZNF497-201ENST00000311044 3468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 TOMM22-201ENST00000216034 2040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ARPC1A-201ENST00000262942 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 VCAN-211ENST00000513984 1825 ntTSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.38
PCNX1Q96RV3 EPS8L2-201ENST00000318562 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 CTSL-202ENST00000342020 933 ntTSL 2 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 JPT2-203ENST00000382711 894 ntTSL 4 BASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 LINC00265-2P-201ENST00000413372 782 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 HLA-DPA2-205ENST00000433582 733 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 IFI35-204ENST00000438323 1232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.65□□□□□ -0.39
PCNX1Q96RV3 STK24P1-201ENST00000455035 1291 ntBASIC12.65□□□□□ -0.39
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