Protein–RNA interactions for Protein: Q96DM1

PGBD4, PiggyBac transposable element-derived protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGBD4Q96DM1 IRF8-201ENST00000268638 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 KCNMA1-202ENST00000286628 6233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SLC35E2-202ENST00000355439 2078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GDAP1L1-207ENST00000612599 2585 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 RALGDS-201ENST00000372047 3598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ELP5-203ENST00000396627 1389 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 MEGF11-204ENST00000422354 5914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 HIF3A-206ENST00000472815 1709 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CALR3-201ENST00000269881 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 LDHBP1-201ENST00000455730 1119 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 MYL7-209ENST00000458240 791 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SNHG21-204ENST00000559366 674 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 STRADA-221ENST00000582137 1238 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 MIR6727-201ENST00000620702 65 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PRKRIP1-201ENST00000397912 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC079336.5-201ENST00000581360 2480 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GRM7-215ENST00000486284 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 EDEM2-202ENST00000374492 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 F2RL1-201ENST00000296677 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 FECH-201ENST00000262093 3853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 NOTCH4-201ENST00000375023 6745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SCAMP4-202ENST00000409472 2394 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AL669918.1-201ENST00000452392 2705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 LGALS8-203ENST00000341872 2437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 UBL4B-201ENST00000334179 1478 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC215219.1-201ENST00000400706 1817 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 C1orf228-218ENST00000458657 1818 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ERG-207ENST00000398919 1868 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 VDAC1-201ENST00000265333 1953 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 ANK1-201ENST00000265709 6379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 TNNT2-202ENST00000360372 969 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 TNNT2-204ENST00000367317 1050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 SNRPC-202ENST00000374017 1054 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PUS10-202ENST00000398658 1227 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 CRYBB3-202ENST00000404334 601 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
PGBD4Q96DM1 AC005392.1-201ENST00000419624 500 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.6 ms