Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 MIR762HG-203ENST00000570025 1429 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZNF821-214ENST00000565601 1858 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PPL-201ENST00000345988 6238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 FGD6-203ENST00000546711 4568 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CLIP2-203ENST00000395060 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC026790.1-201ENST00000399760 2941 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 KIF17-203ENST00000400463 3731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SCFD1-203ENST00000458591 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 KIF1A-201ENST00000320389 8832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CENPBD1-201ENST00000314994 2744 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MOG-221ENST00000376917 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZNF333-209ENST00000601134 1392 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CHRNA3-201ENST00000326828 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TMEM63C-201ENST00000298351 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC136604.1-202ENST00000425471 771 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 Z98749.2-207ENST00000443658 679 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AF111167.2-202ENST00000558267 599 ntTSL 4 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC126696.1-201ENST00000561567 756 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CMTM3-212ENST00000566121 572 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 POLG-201ENST00000268124 4500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 EGFR-206ENST00000454757 5464 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 C8orf31-201ENST00000395172 1875 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 NRG1-201ENST00000287842 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 UMODL1-203ENST00000400424 5516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GNAI2-201ENST00000266027 2169 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC046130.1-201ENST00000501954 2179 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PLIN3-207ENST00000592528 2154 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PTPN9-201ENST00000306726 3862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC138028.2-202ENST00000567968 4528 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RER1-207ENST00000488353 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ATG9A-201ENST00000361242 3130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GMPR2-204ENST00000420554 1864 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GMPR2-223ENST00000559836 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ADAMTS14-201ENST00000373207 5260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PYROXD2-201ENST00000370575 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MAP2K3-214ENST00000613338 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MRVI1-204ENST00000527509 2686 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AL157392.1-201ENST00000412388 373 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ZNF529-AS1-201ENST00000448373 1004 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GNG4-205ENST00000484517 684 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC008808.1-201ENST00000508923 432 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 FXYD6-202ENST00000524656 1033 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CATSPERZ-203ENST00000539943 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AL596325.1-201ENST00000563991 1082 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC132938.2-201ENST00000579188 680 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 AC005391.1-201ENST00000613285 341 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 EDIL3-201ENST00000296591 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 CDH16-201ENST00000299752 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 OSMR-201ENST00000274276 5539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 RNASEH2C-201ENST00000308418 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 ITGB2-206ENST00000397852 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SLC6A6P1-201ENST00000413933 1850 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 PPP2R1B-204ENST00000426998 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
ATL3Q6DD88 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms