Protein–RNA interactions for Protein: Q53GT1

KLHL22, Kelch-like protein 22, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KLHL22Q53GT1 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC138696.2-201ENST00000607376 223 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MVK-217ENST00000639206 367 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 OSBPL2-201ENST00000313733 4009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LIMS4-204ENST00000632897 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 CNP-202ENST00000393892 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 CYB5D1-203ENST00000571846 1870 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TRAF3IP3-204ENST00000367026 2058 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ERAP1-201ENST00000296754 5495 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 CSPG4P11-201ENST00000560634 4910 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 GFAP-201ENST00000253408 3135 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 UBE2F-223ENST00000612130 2135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 NFYC-215ENST00000456393 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 UGGT2-204ENST00000397618 1547 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MED6-201ENST00000256379 1995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TMEM26-202ENST00000399298 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SERPING1-201ENST00000278407 2002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AMT-221ENST00000538581 2038 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PDYN-AS1-201ENST00000446562 1802 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MUC1-228ENST00000620103 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AP002761.4-201ENST00000565433 3361 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MCF2L-204ENST00000375608 3648 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LDB3-207ENST00000542786 1889 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AMOTL2-202ENST00000422605 4335 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 DMAC1-201ENST00000358227 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 OSBP2-219ENST00000535268 3248 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 DISC1-206ENST00000366637 6848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SUGP2-203ENST00000452918 6176 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ENO2-205ENST00000535366 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TEN1-201ENST00000397640 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AL161932.2-201ENST00000435436 679 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 FOLR3-201ENST00000442948 805 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ALAD-201ENST00000409155 3173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 DEK-202ENST00000397239 3427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 EBP-205ENST00000495186 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MAP4-204ENST00000395734 5590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 NUP98-204ENST00000397004 3923 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 USP40-208ENST00000450966 5616 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SLC7A7-201ENST00000285850 2263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 PAX5-214ENST00000523241 1342 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 EDC3-201ENST00000315127 3763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SUOX-202ENST00000356124 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SPATA7-217ENST00000556553 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 XIRP1-203ENST00000421646 2596 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 SLC29A4-201ENST00000297195 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 LHX6-210ENST00000559895 3587 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 ADGRG6-204ENST00000367609 6887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
KLHL22Q53GT1 BAK1-202ENST00000374467 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms