Protein–RNA interactions for Protein: Q15904

ATP6AP1, V-type proton ATPase subunit S1, humanhuman

Predictions only

Length 470 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6AP1Q15904 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SYBU-235ENST00000533895 3244 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RBSN-207ENST00000476527 3005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ZBTB20-206ENST00000464560 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TUBGCP4-201ENST00000260383 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SLC5A5-201ENST00000222248 3576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TBC1D2-204ENST00000375066 3198 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC007666.1-201ENST00000443935 1838 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AXIN2-201ENST00000307078 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC009093.10-201ENST00000641956 1442 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CCDC13-201ENST00000310232 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 URGCP-207ENST00000453200 4042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MAP2K4P1-202ENST00000602584 2539 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 G6PD-201ENST00000369620 1799 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 KAZN-205ENST00000400798 3643 ntTSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SPTBN2-210ENST00000611817 2890 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MCPH1-AS1-201ENST00000515608 2147 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PPP4R3B-205ENST00000616288 4310 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CDK20-209ENST00000605159 1860 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MLPH-201ENST00000264605 3823 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ANGPTL2-201ENST00000373417 2575 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PCM1-201ENST00000325083 6820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PLD1-201ENST00000331659 2906 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 JOSD1-201ENST00000216039 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 LINC00567-201ENST00000569854 3409 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ARHGAP45-203ENST00000543365 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CKMT2-203ENST00000437669 1479 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 IL1RAP-209ENST00000422940 1957 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TAMM41-205ENST00000444133 1619 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CSPG4-201ENST00000308508 8290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 LINC01663-201ENST00000614596 535 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CR392039.2-201ENST00000623182 509 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PPP1R13L-201ENST00000360957 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TCOF1-207ENST00000504761 4467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CDK2-201ENST00000266970 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SFMBT2-203ENST00000379713 2402 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TMBIM1-202ENST00000396809 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PLPP6-201ENST00000381883 2944 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 NGLY1-205ENST00000417874 2062 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC105345.1-202ENST00000382488 3204 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 HERC5-201ENST00000264350 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TRHDE-AS1-201ENST00000426250 3684 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 ANXA11-201ENST00000265447 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CD34-203ENST00000367036 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TRAIP-201ENST00000331456 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TAF12-201ENST00000263974 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 COL4A2-AS2-201ENST00000458403 1522 ntTSL 2 BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.44□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 LARP4-201ENST00000293618 6296 ntTSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 C12orf76-201ENST00000309050 1964 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 NCS1-201ENST00000372398 4991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 VGLL3-202ENST00000398399 10400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 OR2V1-204ENST00000641551 2423 ntAPPRIS P1 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CLUHP2-201ENST00000426660 1303 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 TUBB4AP1-201ENST00000450755 1325 ntBASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 FMNL3-205ENST00000550488 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AGPAT3-205ENST00000398063 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 DYNC1I1-201ENST00000324972 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 APBA2-212ENST00000561069 3138 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 MYO1G-201ENST00000258787 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 CYB5A-202ENST00000340533 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 POLD1-210ENST00000599857 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 AGAP2-203ENST00000547588 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SGMS1-202ENST00000361781 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 KLHL8-201ENST00000273963 5621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RNF214-201ENST00000300650 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 SMPDL3B-202ENST00000373894 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.43□□□□□ -0.26
ATP6AP1Q15904 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC13.43□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 136.9 ms