Protein–RNA interactions for Protein: Q15003

NCAPH, Condensin complex subunit 2, humanhuman

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Length 741 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCAPHQ15003 AL136309.1-201ENST00000403917 691 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RPL28-203ENST00000428193 573 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC099552.1-201ENST00000431083 744 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RPL28-204ENST00000431533 590 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RPL28-207ENST00000558815 616 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC108134.4-201ENST00000570700 302 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 WNT7A-201ENST00000285018 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ALAS2-202ENST00000335854 1795 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RREB1-210ENST00000611109 3563 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DCAF13-209ENST00000616836 2639 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DLGAP1-AS1-201ENST00000317114 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FGFR3-201ENST00000260795 4132 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ARHGEF2-201ENST00000313667 2958 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPPL2B-209ENST00000613503 3456 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TSPAN31-201ENST00000257910 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GCOM1-214ENST00000587652 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 VAMP2-201ENST00000316509 2153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 RBM6-211ENST00000443081 4010 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 C21orf59-203ENST00000382549 2503 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PDCD6IPP2-206ENST00000566178 3351 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 UBA5-202ENST00000356232 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC108024.1-201ENST00000626286 1721 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ERAL1-201ENST00000254928 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 XRCC6-202ENST00000360079 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TMEM41A-203ENST00000421852 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TCEA2-203ENST00000361317 1427 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SIRPA-202ENST00000358771 3996 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PLCD4-202ENST00000417849 2738 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ENDOV-201ENST00000323854 1226 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 IFNL3-201ENST00000413851 656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC002472.2-201ENST00000442739 958 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC078785.1-201ENST00000496389 734 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC090502.1-202ENST00000515416 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FAM98B-202ENST00000397609 4388 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ARHGEF10-207ENST00000520359 5472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 UQCRFS1-201ENST00000304863 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LRSAM1-201ENST00000300417 3146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC092143.1-201ENST00000556922 2776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 FARP2-201ENST00000264042 4051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MAP7D2-204ENST00000452324 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC005865.2-203ENST00000636557 2959 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 NLRX1-201ENST00000292199 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 DSN1-204ENST00000426836 2441 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AP003969.2-201ENST00000623739 2275 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LILRA1-201ENST00000251372 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC127496.1-201ENST00000576234 3133 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 USP49-201ENST00000373006 3177 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SLC8A2-203ENST00000542837 3603 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LHX1-201ENST00000614239 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 POLM-201ENST00000242248 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ATP11B-201ENST00000323116 7325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 MBD6-201ENST00000355673 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AL445209.1-201ENST00000607269 3491 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 ANO7-202ENST00000402430 2652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 TEX26-AS1-205ENST00000585870 2053 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CAP1-203ENST00000372797 3105 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CTCFL-208ENST00000432255 2955 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 CCDC159-201ENST00000458408 1062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
NCAPHQ15003 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
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