Protein–RNA interactions for Protein: Q14C86

GAPVD1, GTPase-activating protein and VPS9 domain-containing protein 1, humanhuman

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Length 1,478 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GAPVD1Q14C86 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SAMD5-201ENST00000367474 6089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RNF181-201ENST00000306368 569 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 IGLV3-9-201ENST00000390316 461 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RNF181-203ENST00000441634 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RNA5SP288-201ENST00000516075 93 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MYL6-215ENST00000549566 685 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC120498.5-201ENST00000561757 299 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RN7SL478P-201ENST00000584358 298 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HIST1H3E-201ENST00000614911 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RERG-201ENST00000256953 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GUCY2EP-203ENST00000531117 1918 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NRG1-211ENST00000520502 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GGA1-201ENST00000325180 2528 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GLIPR1L2-204ENST00000550916 2609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 BCL2L11-203ENST00000357757 947 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SUMO1-206ENST00000409368 1187 ntTSL 4 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 IGKV1OR2-108-201ENST00000453673 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC087741.1-205ENST00000572730 750 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ECSIT-211ENST00000592312 1286 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LINC00969-241ENST00000600527 852 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 Metazoa_SRP.173-201ENST00000614020 273 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SRP19-208ENST00000621420 1270 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC138627.1-201ENST00000641127 1257 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC089987.1-201ENST00000551654 2209 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MAD2L1BP-201ENST00000372171 1301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PLEKHG5-201ENST00000340850 4715 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PLEKHG5-211ENST00000535355 4725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AAMP-204ENST00000444053 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 BPIFB6-201ENST00000349552 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 INPP5B-204ENST00000373026 3230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZXDB-201ENST00000374888 5894 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SOX11-201ENST00000322002 8719 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ACVR1B-206ENST00000542485 2362 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 MRPS12-202ENST00000402029 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL157871.1-201ENST00000555428 429 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NAT9-219ENST00000582524 573 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC091132.6-201ENST00000586411 826 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ACTBP9-201ENST00000587663 1099 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 PACRG-AS3-203ENST00000614038 1246 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NCS1-203ENST00000630865 1092 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CDK3-201ENST00000425876 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NRADDP-202ENST00000641269 1585 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CDC25B-203ENST00000344256 3071 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CDC42SE2-202ENST00000395246 3485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 BARHL2-201ENST00000370445 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 KRT8P42-201ENST00000405771 1399 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 RPH3AL-202ENST00000331302 2606 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AC011477.7-201ENST00000617163 1440 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 CLEC10A-206ENST00000576617 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC34A2-202ENST00000503434 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GAPVD1Q14C86 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
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