Protein–RNA interactions for Protein: Q12946

FOXF1, Forkhead box protein F1, humanhuman

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Length 379 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXF1Q12946 HS6ST3-201ENST00000376705 7804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 C7orf33-201ENST00000307003 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 UMODL1-AS1-201ENST00000329015 2141 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 TIE1-201ENST00000372476 3882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 WNT7B-201ENST00000339464 3919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 CD59-201ENST00000351554 1775 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PRSS30P-201ENST00000390681 2881 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 AC008133.1-201ENST00000584688 557 ntTSL 4 BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 CTNNBIP1-202ENST00000377258 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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FOXF1Q12946 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC016700.1-201ENST00000429424 312 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC092580.1-201ENST00000433998 658 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC009487.3-201ENST00000505579 560 ntTSL 4 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MEF2C-227ENST00000626391 1182 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 MEF2C-231ENST00000628656 1254 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 OBSL1-202ENST00000373873 3297 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 PKD1P6-NPIPP1-202ENST00000605794 2902 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
FOXF1Q12946 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
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