Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2I5

IFFO1, Intermediate filament family orphan 1, humanhuman

Predictions only

Length 559 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFFO1Q0D2I5 UNK-205ENST00000589666 3925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PRKCH-201ENST00000332981 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 USH1G-202ENST00000614341 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FKBP6-202ENST00000413573 1507 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RANBP17-219ENST00000523189 4588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HHEX-202ENST00000472590 1605 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ITGA5-201ENST00000293379 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MAOA-204ENST00000542639 5438 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SF1-202ENST00000334944 3094 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PARD6B-201ENST00000371610 4615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL161638.1-201ENST00000420354 481 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TEX48-201ENST00000436752 708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 FAM86LP-201ENST00000478302 853 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TEX48-202ENST00000612244 662 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SRPRB-201ENST00000466490 2827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PPP1R12A-201ENST00000261207 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NLGN3-201ENST00000358741 3046 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 IL11RA-208ENST00000555003 3008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NRROS-201ENST00000328557 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DYNC1I2-203ENST00000409197 2572 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 DYNC1I2-206ENST00000409773 2583 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SOGA1-201ENST00000237536 14371 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 KLHL7-202ENST00000339077 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SLC4A7-203ENST00000425128 7970 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LINC01833-203ENST00000437916 2880 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HNF1B-204ENST00000617811 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPUSD4-201ENST00000298317 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PCDHA6-201ENST00000378126 3267 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HTR2C-201ENST00000276198 4751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC139712.1-201ENST00000378256 1875 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1C-231ENST00000616390 2833 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LGALS9-201ENST00000302228 3018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SH2D3C-201ENST00000314830 3124 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GMIP-201ENST00000203556 3538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM164-203ENST00000372072 4975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RTFDC1-201ENST00000023939 1745 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 NECAP2-202ENST00000443980 1929 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 HOXA7-201ENST00000242159 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 C8B-201ENST00000371237 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TESMIN-204ENST00000443940 3495 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZNF7-202ENST00000446747 2242 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GDPD5-215ENST00000533805 2424 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 EML1-203ENST00000334192 4064 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 GGT1-203ENST00000400382 2628 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 STRA6-202ENST00000395105 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ROBO1-201ENST00000436010 7501 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TRMT112-206ENST00000544844 1106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 BDNF-208ENST00000418212 4125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CACNA1G-232ENST00000515411 6960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ACVR1B-202ENST00000415850 1665 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 PIK3R1-213ENST00000521657 3891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 COG5-201ENST00000297135 4060 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MFSD8-241ENST00000641686 4991 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 MRVI1-202ENST00000424001 5815 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 ALOX15B-202ENST00000380183 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
IFFO1Q0D2I5 CALB1-201ENST00000265431 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
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