Protein–RNA interactions for Protein: Q06546

GABPA, GA-binding protein alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 454 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABPAQ06546 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 BPTF-202ENST00000321892 11292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC020910.6-201ENST00000623084 1459 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 UPK3BL1-201ENST00000340457 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 OXA1L-212ENST00000604262 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AIPL1-207ENST00000574506 2074 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CTSS-202ENST00000448301 1421 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CNBP-201ENST00000422453 1664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IL9RP3-201ENST00000442856 1674 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CAPN7-201ENST00000253693 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPA2-204ENST00000354147 667 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPIE-202ENST00000356511 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TOMM20L-201ENST00000360945 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RAB25-201ENST00000361084 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAT1-201ENST00000379251 801 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAT1-202ENST00000379253 909 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAT1-203ENST00000379254 868 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SAT1-204ENST00000379270 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KRTAP2-2-201ENST00000398477 733 ntAPPRIS P2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CELP-201ENST00000411440 1249 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PPA2-205ENST00000432483 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LINC00887-204ENST00000456816 796 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SCARNA12-201ENST00000459155 270 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RN7SL788P-201ENST00000460504 316 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMC2-204ENST00000562713 573 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HERC2P11-201ENST00000562845 725 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMC2-209ENST00000565108 399 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC100756.2-201ENST00000569537 736 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC073911.3-201ENST00000624401 631 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SERF2-201ENST00000249786 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 PRSS8-201ENST00000317508 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RBP1-205ENST00000492918 1487 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 TUBB8P4-201ENST00000511806 1324 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KRT8P18-201ENST00000413425 1445 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 HTR3E-202ENST00000415389 2139 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 ANKDD1A-202ENST00000395720 1518 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 RIOK3-207ENST00000581585 1966 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GOT2-202ENST00000434819 1615 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 FAM84A-201ENST00000295092 6355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMTM1-201ENST00000328020 981 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMTM1-202ENST00000332695 624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL935212.1-201ENST00000377548 906 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMTM1-205ENST00000379500 1064 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MPC1L-201ENST00000423387 571 ntAPPRIS P1 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL663074.1-201ENST00000436642 299 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NSD2-209ENST00000436793 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC079112.1-201ENST00000454972 939 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC108462.1-201ENST00000457467 850 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC246817.2-203ENST00000517357 569 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC246817.2-202ENST00000519393 564 ntTSL 4 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMTM1-209ENST00000528324 749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CMTM1-217ENST00000533666 493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 NUDT4P2-201ENST00000578341 546 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 AL161773.1-201ENST00000624845 863 ntBASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 CLTCL1-212ENST00000622493 1714 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MAP7D1-204ENST00000373151 3324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
GABPAQ06546 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.6 ms