Protein–RNA interactions for Protein: Q05682

CALD1, Caldesmon, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALD1Q05682 AC046168.2-201ENST00000560590 875 ntTSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MIR3619-201ENST00000579667 83 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PHAX-201ENST00000297540 4288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 SIGLEC9-202ENST00000440804 1960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 CYB5D2-203ENST00000575251 1588 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 DUSP13-208ENST00000478873 1335 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 OPA1-204ENST00000361828 6381 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CALD1Q05682 FDFT1-223ENST00000615631 2462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 WIZ-203ENST00000545156 4466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 DDX21-202ENST00000620315 4829 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZNF655-201ENST00000252713 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TOB1-AS1-201ENST00000416263 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ASCC2-201ENST00000307790 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC103592.1-201ENST00000394513 664 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PLSCR1-214ENST00000487389 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC084346.1-201ENST00000520962 528 ntTSL 4 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 L34079.1-201ENST00000594374 393 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SPIN3-207ENST00000638386 4461 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MAGEA4-202ENST00000360243 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MAGEA4-203ENST00000370335 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MAGEA4-204ENST00000370340 1773 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GCC1-201ENST00000321407 4149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SLC35C1-201ENST00000314134 4171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LRRC41-201ENST00000343304 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SDCBP2-AS1-201ENST00000446423 1811 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PLAU-202ENST00000446342 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 METAP2-205ENST00000546753 1862 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ACKR3-201ENST00000272928 2203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PXN-221ENST00000637617 3246 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 APOL3-207ENST00000424878 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NEU3-202ENST00000526068 431 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CCDC144NL-AS1-209ENST00000577860 884 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 P2RX3-201ENST00000263314 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SEZ6-203ENST00000360295 4306 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SHMT1P1-201ENST00000419974 1312 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FEM1B-201ENST00000306917 7122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 GSTM4-204ENST00000369836 1412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CDH16-202ENST00000394055 2821 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 FAM177A1-202ENST00000382406 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
CALD1Q05682 CMC1-204ENST00000423894 549 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.3 ms