Protein–RNA interactions for Protein: P62829

RPL23, 60S ribosomal protein L23, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 140 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPL23P62829 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AP001007.1-201ENST00000526796 645 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 TNC-212ENST00000542877 5517 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GABARAPL1-217ENST00000545887 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GRIA3-205ENST00000611689 936 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SMC6-201ENST00000351948 5173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GRAMD4-201ENST00000361034 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 IP6K3-201ENST00000293756 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 USP19-206ENST00000417901 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 KCNT1-213ENST00000630792 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 BANK1-202ENST00000428908 3044 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SRRM1-201ENST00000323848 4011 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AL358216.1-201ENST00000451601 1657 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GRIA4-201ENST00000282499 5508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 NPTN-201ENST00000345330 2444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 IL12RB1-207ENST00000600835 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 DNAJB12-202ENST00000394903 3198 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PPT2-EGFL8-202ENST00000422437 4181 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ANO6-203ENST00000425752 3558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ITGA2B-201ENST00000262407 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC009123.1-202ENST00000565643 2551 ntTSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 EFEMP1-201ENST00000355426 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GPRC5A-201ENST00000014914 7362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 MPHOSPH10-201ENST00000244230 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GAS6-AS1-201ENST00000458001 7169 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 OR2A25-202ENST00000641441 1733 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 EME1-202ENST00000393271 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LINC01756-201ENST00000417651 2148 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 MYO7A-202ENST00000409709 7462 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ENG-201ENST00000344849 3059 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PTPRN-202ENST00000409251 3622 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPDYE16-203ENST00000633306 2591 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 NFIX-208ENST00000587260 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 RSPO2-201ENST00000276659 3111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CYYR1-201ENST00000299340 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AEBP1-201ENST00000223357 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SLC5A11-203ENST00000449109 2069 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PLA1A-206ENST00000495992 1695 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CACNA1C-214ENST00000399634 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CACNA1C-222ENST00000406454 7590 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CXorf40A-201ENST00000359293 974 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC022182.2-201ENST00000525556 859 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AL358472.4-201ENST00000633140 710 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 RGMA-203ENST00000542321 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ATF6B-209ENST00000375201 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ATF6B-210ENST00000375203 2620 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 HLA-E-201ENST00000376630 2601 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CD3EAP-202ENST00000589804 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC010547.1-201ENST00000500612 2793 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 GPHN-203ENST00000478722 4297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PDE7B-203ENST00000615259 5234 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 HERC6-202ENST00000273960 3473 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AOC3-201ENST00000308423 4026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ZNF571-AS1-203ENST00000586139 2684 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 ZMYND15-206ENST00000592813 2274 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PIK3CG-205ENST00000496166 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SPIN3-245ENST00000640768 1722 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 TRPC6-201ENST00000344327 4612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LMBR1-201ENST00000353442 7997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LINC00665-203ENST00000438368 1863 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 CNOT7-211ENST00000523917 1885 ntTSL 2 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 PPP1R15B-201ENST00000367188 5227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SLC47A1-201ENST00000270570 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 AC092117.1-201ENST00000621230 3250 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 DCAF5-209ENST00000557386 2883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 COL6A3-206ENST00000409809 8916 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 LLGL1-203ENST00000621229 3187 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
RPL23P62829 SESN2-201ENST00000253063 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL23P62829 OXA1L-202ENST00000358043 1750 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL23P62829 HEXA-206ENST00000566304 1795 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
RPL23P62829 C19orf12-208ENST00000614091 4489 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms