Protein–RNA interactions for Protein: P61218

POLR2F, DNA-directed RNA polymerases I, II, and III subunit RPABC2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 127 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2FP61218 DHCR24-201ENST00000371269 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SCYL1-205ENST00000524944 2715 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KIF6-201ENST00000229913 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HOXA3-207ENST00000612286 3396 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ARHGEF37-201ENST00000333677 4968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EPAS1-201ENST00000263734 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MMAB-210ENST00000545712 4438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FSTL4-201ENST00000265342 5419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FIG4-201ENST00000230124 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CUX2-201ENST00000261726 6844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KIAA0141-201ENST00000194118 2203 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PARVB-201ENST00000338758 5429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 BORCS8-202ENST00000462790 1429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EPHA5-204ENST00000511294 5176 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 IFT20-202ENST00000357896 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC104135.1-201ENST00000418001 763 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NME2P1-201ENST00000426182 414 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC109466.1-209ENST00000486913 1618 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SFSWAP-210ENST00000541286 3219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC099850.1-201ENST00000451775 1338 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ADAM15-209ENST00000449910 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC073548.1-201ENST00000624088 1882 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CNTNAP2-225ENST00000639247 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC13A5-202ENST00000381074 1738 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC012531.2-201ENST00000512206 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 STK3-218ENST00000617590 2485 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL365181.3-201ENST00000605886 3222 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SMARCA2-214ENST00000450198 5602 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TMEM87A-201ENST00000307216 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SHPK-201ENST00000225519 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TMEM231-207ENST00000568377 2920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DLX4-202ENST00000411890 1404 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TRDMT1-203ENST00000377799 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CAMKK2-209ENST00000446440 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NEFH-201ENST00000310624 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DIAPH2-202ENST00000355827 3782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 NFATC3-203ENST00000349223 6328 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SUMO1-204ENST00000409181 784 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SUMO1-207ENST00000409498 779 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 C1RL-212ENST00000545337 813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GNRHR2-204ENST00000604273 1078 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SPIN2A-203ENST00000614076 966 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PSG4-203ENST00000433626 1887 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ERICH6-201ENST00000295910 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KLHL13-204ENST00000371882 3256 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TRIM25-201ENST00000316881 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 KIRREL2-203ENST00000360202 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GET4-202ENST00000407192 4356 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 C11orf21-201ENST00000381153 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 RAPGEF3-218ENST00000548919 2776 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 SMAGP-203ENST00000603798 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PISD-209ENST00000439502 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 PML-202ENST00000268059 3029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 TTC39A-216ENST00000530004 1780 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 DDC-207ENST00000444124 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 OR3A2-205ENST00000641164 2033 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
POLR2FP61218 GMCL1-201ENST00000282570 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms