Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LINC01107-201ENST00000446979 1975 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 PPT1-205ENST00000449045 1957 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 MSI2-202ENST00000322684 1860 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 GMEB1-202ENST00000361872 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LRIF1-202ENST00000485275 1796 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 C11orf16-202ENST00000525780 1685 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 E2F6-212ENST00000546212 3191 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 RCC1-201ENST00000373831 1577 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 NDFIP2-201ENST00000218652 4625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC006372.4-201ENST00000624122 1543 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 VAMP2-202ENST00000404970 1479 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LIPE-AS1-204ENST00000594624 1448 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 CDH23-202ENST00000299366 3954 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LCE3B-201ENST00000335633 288 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 RN7SKP109-201ENST00000410592 316 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 BCAS2P2-201ENST00000425064 674 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 HOXB-AS3-206ENST00000474040 741 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC132803.1-201ENST00000504204 493 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 RPS25-202ENST00000527673 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 NACA-221ENST00000552540 1074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC012379.2-201ENST00000560237 765 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC136624.2-201ENST00000574883 542 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC005357.2-202ENST00000590507 1060 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC140113.1-201ENST00000603467 169 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC007250.1-201ENST00000608934 338 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC009145.4-201ENST00000625119 1294 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 AC009975.2-202ENST00000634539 854 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 GDI2-203ENST00000380191 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
PROK1P58294 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 GTF2IRD1-201ENST00000265755 3430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ATG2A-201ENST00000377264 6357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 LETMD1-203ENST00000418425 2123 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 AC025674.2-201ENST00000522622 2971 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ZNF417-203ENST00000595559 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ZNF280D-207ENST00000559237 4902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 SLC44A3-209ENST00000532427 1912 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TUSC3-201ENST00000382020 3683 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 BHMG1-201ENST00000457052 2749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ZNF70-201ENST00000341976 6924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CUL3-201ENST00000264414 6741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ZNF174-201ENST00000268655 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TAF1C-216ENST00000566732 2972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TMEM115-201ENST00000266025 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CBX3-201ENST00000337620 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 TMEM176B-201ENST00000326442 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 Metazoa_SRP.4-201ENST00000366232 298 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 BGLAP-201ENST00000368272 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 CCDC167-201ENST00000373408 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
PROK1P58294 MIR503HG-202ENST00000440570 760 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.8 ms