Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 ACP7-201ENST00000331256 2966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMEM91-202ENST00000356385 944 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MIPEPP3-202ENST00000424756 347 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 NDRG1-209ENST00000518176 888 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC025442.1-201ENST00000521596 481 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMEM123-201ENST00000361236 3321 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SGK3-208ENST00000521198 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HLA-DQB1-205ENST00000434651 1642 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 UGGT2-201ENST00000376712 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 SGCZ-201ENST00000382080 2234 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 MKRN1-201ENST00000255977 3151 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ADORA2A-AS1-201ENST00000326341 2557 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 ZNF75A-205ENST00000574298 2347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 CTNNB1-202ENST00000396183 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 FOXP3-204ENST00000455775 2448 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 BEND3P3-201ENST00000611030 2440 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 HCFC2-201ENST00000229330 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
UBASH3AP57075 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 WARS2-201ENST00000235521 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AL359643.2-201ENST00000606227 3273 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NFKB1-201ENST00000226574 4085 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ITGB4-202ENST00000449880 5689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CD99L2-208ENST00000613030 3742 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LINC01671-201ENST00000419628 1775 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MEF2C-AS1-210ENST00000514011 1754 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GLRX3-202ENST00000368644 3827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC007663.2-201ENST00000506039 2228 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FIBCD1-204ENST00000448616 3119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 HMGCL-203ENST00000374490 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TFAM-204ENST00000487519 5414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SLC46A3-201ENST00000266943 3173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 EFR3B-202ENST00000401432 5162 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 RPF1-202ENST00000370656 724 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CBFB-203ENST00000561924 584 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TIPARP-201ENST00000295924 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 IRF6-204ENST00000542854 4256 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MICAL1-202ENST00000358807 3645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 VIPR1-202ENST00000433647 3161 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 DDX31-202ENST00000372153 3285 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SMIM12-206ENST00000521580 3454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GLB1L-201ENST00000295759 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TNS2-219ENST00000552570 4714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 CFAP74-209ENST00000493964 5247 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 NME1-209ENST00000511355 1645 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC098936.1-201ENST00000442318 2885 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 F2-205ENST00000530231 1849 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 TMPRSS6-201ENST00000346753 3197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 KIF3C-202ENST00000405914 3180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GTF2IRD2B-203ENST00000472837 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ARAF-201ENST00000290277 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C9orf24-201ENST00000297623 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AC011450.1-202ENST00000358234 573 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C9orf24-205ENST00000379133 712 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 AL391647.1-201ENST00000395664 511 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
UBASH3AP57075 SEPT7P9-202ENST00000489259 743 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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