Protein–RNA interactions for Protein: P53814

SMTN, Smoothelin, humanhuman

Predictions only

Length 917 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMTNP53814 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IP6K2-205ENST00000413298 792 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 EIF4HP1-201ENST00000453115 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MARK2P5-201ENST00000507649 634 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 HMGCLL1-208ENST00000508459 884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ALKBH7-202ENST00000596657 603 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL451050.2-201ENST00000606967 682 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC104506.1-201ENST00000609247 429 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC068790.8-201ENST00000618862 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 HPD-204ENST00000543163 1709 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GPN2-202ENST00000374135 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CICP17-201ENST00000418553 2377 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KDM5B-202ENST00000367264 6449 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 BEND6-203ENST00000370748 3497 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CRYBG2-201ENST00000308182 5245 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KDR-201ENST00000263923 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CHAT-212ENST00000640822 1412 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL365205.1-204ENST00000359201 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FGGY-203ENST00000371212 1640 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DDR1-271ENST00000513240 2882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ID2-203ENST00000396290 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RLIM-202ENST00000349225 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DEF8-219ENST00000567874 1554 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MAP3K4-204ENST00000392142 5490 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 XRCC3-211ENST00000555055 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 MARC1-201ENST00000366910 7439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PAX7-202ENST00000400661 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CDKN1A-208ENST00000615513 2102 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AFAP1L1-205ENST00000515000 2319 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SPOCK3-202ENST00000357545 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 PRDM16-203ENST00000378391 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LRP5L-202ENST00000402859 1661 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 C15orf59-204ENST00000569673 6573 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 IER3-201ENST00000259874 1244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC078875.1-201ENST00000431907 724 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LINC00431-201ENST00000440735 1189 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 C12orf57-206ENST00000544681 980 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC003686.1-201ENST00000550956 1034 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 LAMB2-202ENST00000418109 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 NOP14-AS1-201ENST00000503709 1616 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 VSIR-201ENST00000394957 4689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 RPUSD2-201ENST00000315616 2358 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 APP-205ENST00000358918 2366 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 POLL-205ENST00000370169 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SLC38A4-201ENST00000266579 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CDH20-202ENST00000536675 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TMUB2-202ENST00000357984 1921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ARPC4-TTLL3-201ENST00000397256 2466 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ZBED8-202ENST00000523213 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TUBA3C-202ENST00000618094 1386 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CNOT9-201ENST00000273064 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CABP4-201ENST00000325656 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SEPT9-220ENST00000588690 2919 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 C7orf72-201ENST00000297001 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 POLM-203ENST00000395831 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TBC1D1-214ENST00000508802 4119 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SMARCA4-214ENST00000589677 5181 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CDCA7-202ENST00000347703 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AFDN-205ENST00000392108 6812 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 TTLL10-AS1-201ENST00000379317 3532 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SUCO-201ENST00000263688 5556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CCDC180-210ENST00000529487 5242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 GPX3-201ENST00000388825 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 ACSL1-201ENST00000281455 3832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL022323.1-201ENST00000366110 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SYNGR1-204ENST00000381535 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL391119.1-201ENST00000416563 271 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AL008707.1-201ENST00000422498 534 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 XBP1P1-201ENST00000436573 652 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
SMTNP53814 AC097103.2-206ENST00000514729 588 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.7 ms