Protein–RNA interactions for Protein: P48742

LHX1, LIM/homeobox protein Lhx1, humanhuman

Predictions only

Length 406 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LHX1P48742 AC138761.4-201ENST00000578881 1514 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 STX1B-201ENST00000215095 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 DBR1-201ENST00000260803 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 DEFB123-201ENST00000376309 467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC006987.1-201ENST00000413610 527 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AL807761.2-201ENST00000422849 729 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 LINC02046-201ENST00000469812 378 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC019193.1-201ENST00000506678 823 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AHNAK-205ENST00000530124 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AP001160.1-201ENST00000535817 565 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 MESP2-203ENST00000560219 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ELP5-212ENST00000574255 671 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC093330.1-206ENST00000582546 812 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 RPL18A-204ENST00000599898 491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC007326.1-201ENST00000604539 458 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TBC1D24-205ENST00000567020 6673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TTC39A-208ENST00000413473 2718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TMEM45A-202ENST00000403410 1910 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 COL5A1-201ENST00000371817 8471 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 GPR84-202ENST00000551809 2041 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SEMA5B-206ENST00000451055 4579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 RNF170-209ENST00000534961 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 MSH5-203ENST00000375750 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 EPHX1-202ENST00000366837 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 HNRNPU-226ENST00000640218 6858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CACNA2D1-201ENST00000356253 3858 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AL590824.1-201ENST00000403828 1349 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 C3orf52-202ENST00000431717 2054 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 FAM46C-201ENST00000369448 5751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 KLK6-201ENST00000310157 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 GAD2-201ENST00000259271 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TBC1D16-209ENST00000576768 6342 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 NATD1-201ENST00000611551 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 MUTYH-210ENST00000450313 1929 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ZNF460-202ENST00000537645 2037 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 HMGA1P1-201ENST00000415560 1062 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 BX324167.1-201ENST00000451118 805 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CCDC18-AS1-219ENST00000451302 1212 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 PPP2R1A-209ENST00000477989 444 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SIRT3-210ENST00000529382 1225 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 LGALS3-204ENST00000554715 916 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 C19orf25-205ENST00000588427 853 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC009560.1-201ENST00000620208 434 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC007718.1-201ENST00000621078 280 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AC051619.9-201ENST00000623237 597 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CNOT7-213ENST00000628418 432 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CHD4-201ENST00000357008 6496 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CFAP36-201ENST00000339012 1373 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SHTN1-204ENST00000392903 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ACVR1C-204ENST00000409680 1786 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 NARFL-202ENST00000540986 3212 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 IMPDH1-203ENST00000354269 2580 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CYTH3-201ENST00000350796 4505 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 CYTH3-202ENST00000396741 4508 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
LHX1P48742 PCBP1-AS1-214ENST00000419542 1309 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 AL513327.1-206ENST00000587696 1432 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 MOV10L1-202ENST00000354853 1701 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ARHGAP25-216ENST00000497079 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 COG3-206ENST00000617493 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 FAM124B-201ENST00000243806 2030 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 C2orf68-201ENST00000306336 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ZNF664-202ENST00000392404 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
LHX1P48742 ATG4B-206ENST00000405546 3294 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms