Protein–RNA interactions for Protein: P48230

TM4SF4, Transmembrane 4 L6 family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TM4SF4P48230 MEFV-203ENST00000536379 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 ABCB6-201ENST00000265316 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
TM4SF4P48230 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AL139158.3-201ENST00000641212 1562 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GTF2A1L-201ENST00000403751 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PRORSD1P-202ENST00000563365 2154 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GLIPR1L2-201ENST00000320460 1729 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 EXOSC7-201ENST00000265564 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 OR6S1-201ENST00000320704 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ECHDC2-201ENST00000358358 1126 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PAX5-203ENST00000377847 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FAM9C-202ENST00000380625 1122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ACOT6-201ENST00000381139 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 BX088651.3-201ENST00000418155 352 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AL021391.1-201ENST00000454439 545 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PRSS46-201ENST00000463091 982 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DLG4-206ENST00000485100 1004 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PRSS55-203ENST00000522210 1005 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PAX5-213ENST00000523145 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC117834.1-201ENST00000523197 602 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 OR4A49P-201ENST00000527050 632 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TBX5-AS1-202ENST00000531024 766 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AP003168.2-201ENST00000531215 471 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LINC00643-202ENST00000553426 526 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CDC37P2-201ENST00000562287 1029 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LIMD2-210ENST00000582055 509 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC011483.3-201ENST00000601506 826 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SNX20-205ENST00000610485 557 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 OASL-202ENST00000339275 1492 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CMBL-201ENST00000296658 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SPAG1-205ENST00000520508 1796 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC011462.1-202ENST00000540732 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FAM83A-AS1-202ENST00000520576 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 METTL7B-201ENST00000394252 1506 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SOCS2-212ENST00000622746 2881 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 WFDC3-201ENST00000243938 1000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SH3BGR-202ENST00000380631 780 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FOLR1-204ENST00000393681 1061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 INMT-202ENST00000409539 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 GHRL-206ENST00000430179 856 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 LINC01824-201ENST00000436082 528 ntTSL 4 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC103563.2-201ENST00000442200 597 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 AC002996.1-201ENST00000546840 784 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 DLX6-203ENST00000555308 666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HNRNPC-221ENST00000555883 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ABCD1P3-201ENST00000562927 605 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TPST2P1-201ENST00000564073 1102 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MSRB1-205ENST00000564908 550 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 PCTP-206ENST00000573500 919 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 CYP1B1-AS1-204ENST00000589303 579 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 RPS5-205ENST00000598495 800 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HCG18-241ENST00000602290 821 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ZFAS1-208ENST00000618800 597 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ECI2-201ENST00000361538 1380 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 MYC-206ENST00000613283 1365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FAM167A-AS1-203ENST00000624614 1357 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 NME7-203ENST00000472647 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 TLDC2-201ENST00000217320 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 FLOT2-201ENST00000394906 2756 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
TM4SF4P48230 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38 ms