Protein–RNA interactions for Protein: P43121

MCAM, Cell surface glycoprotein MUC18, humanhuman

Predictions only

Length 646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCAMP43121 MKNK1-204ENST00000371946 2719 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TATDN3-201ENST00000366973 2321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 INPP4A-202ENST00000409016 9996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 PGRMC1-201ENST00000217971 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AP1M2-201ENST00000250244 1749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
MCAMP43121 AL139082.1-201ENST00000613982 3433 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CRACR2A-201ENST00000252322 2186 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
MCAMP43121 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RNF122-201ENST00000256257 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RASGRF1-202ENST00000419573 6294 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DDHD1-202ENST00000357758 5603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LHFPL3-201ENST00000401970 1378 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DIO3OS-208ENST00000556120 2473 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CABP1-203ENST00000351200 770 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TNNT2-206ENST00000367320 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAPK13-202ENST00000373759 1036 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LY6G6E-227ENST00000409239 776 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GYPC-203ENST00000409836 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DCAF7-201ENST00000415273 1220 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 Metazoa_SRP.9-201ENST00000415635 283 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PPP1R2P4-201ENST00000424051 595 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL391415.1-201ENST00000439844 400 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC098935.1-201ENST00000446057 611 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SOX9-AS1-207ENST00000446332 443 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC112487.1-201ENST00000498032 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC010285.2-201ENST00000510240 569 ntTSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TVP23C-205ENST00000518321 1080 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC010531.4-203ENST00000561709 660 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 IGHV3OR16-12-201ENST00000570121 353 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC005498.2-204ENST00000590613 413 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC242426.4-201ENST00000606856 573 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HIST1H3C-201ENST00000612966 411 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 IFI27-215ENST00000621160 644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CCDC169-SOHLH2-201ENST00000511166 2051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CDH1-213ENST00000612417 2068 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 KCNC1-201ENST00000265969 4295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 STAMBPL1-204ENST00000371927 4184 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DPEP2-202ENST00000393847 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC090643.2-201ENST00000623442 2029 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
MCAMP43121 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CCNB1-201ENST00000256442 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC109460.1-201ENST00000567209 1478 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ADCY2-201ENST00000338316 6575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CYB561-201ENST00000360793 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AGFG1-204ENST00000409315 2912 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MXD1-201ENST00000264444 5587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 XKRX-202ENST00000468904 2249 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FERMT3-202ENST00000345728 2481 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CGB1-201ENST00000301407 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 C7orf57-201ENST00000348904 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CST9L-201ENST00000376979 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TRO-205ENST00000399736 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AL355376.1-201ENST00000456082 517 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC092535.3-201ENST00000504969 468 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 GOLGA2P8-201ENST00000505201 779 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 NEU3-207ENST00000534628 746 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TRMT10B-207ENST00000537911 2108 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LINC01584-201ENST00000562495 676 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 CYP1A1-207ENST00000567032 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TP53-221ENST00000615910 1149 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HERPUD1-203ENST00000379792 1782 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LINC01230-201ENST00000625222 3017 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 ASB15-207ENST00000540573 1651 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 TRMT2B-201ENST00000372935 2921 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 IARS2-201ENST00000366922 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 LINC01184-204ENST00000501702 2977 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 UBA1-202ENST00000377269 2497 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 AC068760.1-201ENST00000493579 1953 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
MCAMP43121 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.9 ms