Protein–RNA interactions for Protein: P38570

ITGAE, Integrin alpha-E, humanhuman

Predictions only

Length 1,179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAEP38570 KCP-203ENST00000610776 5108 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 JTB-202ENST00000356648 1040 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TCEAL6-201ENST00000372773 983 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ELK2AP-201ENST00000392510 1007 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SAPCD1-208ENST00000415669 916 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC131097.3-203ENST00000420272 1193 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC00686-201ENST00000435412 332 ntTSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 IMPA2-207ENST00000588927 787 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC005779.2-201ENST00000593083 550 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 GPRC5B-209ENST00000569479 2984 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLCO2B1-203ENST00000428359 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SYNGR1-203ENST00000328933 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CASC2-202ENST00000426021 3232 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 POU2F2-204ENST00000526816 3218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 GLI2-210ENST00000452319 6799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TSPAN18-207ENST00000520358 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC064801.2-201ENST00000625052 1303 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZSCAN5A-206ENST00000587492 1542 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RGPD6-202ENST00000330331 2848 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RGPD8-202ENST00000330575 2848 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PDZD7-206ENST00000619208 4135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 C1orf43-206ENST00000368521 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 HMGA2-210ENST00000541363 8094 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TRIM23-202ENST00000274327 1829 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC090505.1-201ENST00000430515 1834 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PHTF2-206ENST00000422959 3525 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 B3GNT7-201ENST00000287590 3706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MBP-201ENST00000354542 575 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RNF144A-AS1-203ENST00000426122 579 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC093904.2-201ENST00000495580 418 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC005833.2-201ENST00000527518 1249 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 KCNJ11-204ENST00000528731 2146 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL049833.2-202ENST00000556773 626 ntTSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 EFHC1-227ENST00000637089 2133 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TRIM67-201ENST00000366653 3936 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TTC29-208ENST00000513335 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CCNH-201ENST00000256897 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZFYVE28-201ENST00000290974 4131 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LINC02396-202ENST00000550636 2324 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ANKMY1-203ENST00000373318 2449 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PDLIM2-201ENST00000265810 4592 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ENDOD1-201ENST00000278505 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 CDIP1-205ENST00000563332 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NBPF26-208ENST00000620612 4602 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ADORA1-201ENST00000309502 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC005523.2-201ENST00000601192 3568 ntTSL 4 BASIC21.81■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 METTL17-221ENST00000556670 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PAF1-204ENST00000595564 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLC35B2-206ENST00000615337 2014 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SYT9-201ENST00000318881 3955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ELAVL2-201ENST00000223951 3763 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LIMK2-203ENST00000340552 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AGPAT1-205ENST00000395497 2168 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AMHR2-201ENST00000257863 1863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC022007.1-201ENST00000383808 1897 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ZCCHC13-201ENST00000339534 842 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 LAMA4-208ENST00000431543 1080 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 EEF1DP6-201ENST00000449232 372 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SNHG14-206ENST00000450809 677 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 ATP6V1G2-210ENST00000483251 662 ntTSL 3 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 PIN1-207ENST00000588695 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
ITGAEP38570 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms