Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MAPK15-203ENST00000395108 765 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC010141.1-201ENST00000411585 623 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC103563.7-201ENST00000448734 478 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FBXL12-211ENST00000591009 1005 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NPIPB11-202ENST00000614927 1216 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GRM5-AS1-201ENST00000526448 4821 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CLCN6-201ENST00000312413 5631 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SLC23A1-201ENST00000348729 2299 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ABCC6-201ENST00000205557 5747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 THAP2-201ENST00000308086 5719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GALC-206ENST00000544807 2528 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AP002851.1-201ENST00000640504 2130 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 HLA-DPA1-242ENST00000419277 1704 ntAPPRIS P2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC009690.1-201ENST00000379915 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RBM6-201ENST00000266022 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYTH2-203ENST00000427476 4606 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FRMD4B-201ENST00000398540 5060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC007240.1-201ENST00000641498 1996 ntAPPRIS P1 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 SOX21-AS1-201ENST00000438290 3287 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TCL1A-203ENST00000554012 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MED15-203ENST00000382974 2235 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FANCC-201ENST00000289081 4585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NR4A1-213ENST00000550082 2029 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC027288.3-202ENST00000550268 1820 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ARID3B-206ENST00000622429 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 STX16-207ENST00000371141 4937 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RABL6-211ENST00000629216 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 OGFOD1-209ENST00000568397 1681 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KRT4-204ENST00000551956 2576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LAMB1-201ENST00000222399 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 YTHDF3-209ENST00000617200 5076 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C11orf16-201ENST00000326053 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RPL13-204ENST00000452368 1455 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RHOH-220ENST00000615083 2156 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GBGT1-202ENST00000372038 847 ntTSL 3 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TCEAL1-203ENST00000372626 721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CICP12-201ENST00000455801 843 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC005586.2-201ENST00000563946 837 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC011447.3-204ENST00000585498 883 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC012615.4-201ENST00000586694 607 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DBNDD1-203ENST00000392973 2689 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CCND3-201ENST00000372987 2233 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 FASN-201ENST00000306749 8565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TYK2-210ENST00000529370 3176 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ATN1-201ENST00000356654 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MBP-204ENST00000382582 2281 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ACSF2-202ENST00000427954 2251 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LINC01271-201ENST00000441214 2250 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LSS-211ENST00000522411 2523 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 APBB1-220ENST00000609331 1574 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TBC1D22A-201ENST00000337137 3787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 MAGI1-218ENST00000621418 6225 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ARHGAP45-201ENST00000313093 4273 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 GIT1-211ENST00000581348 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ZBTB2-201ENST00000325144 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYTH1-201ENST00000361101 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CYTH1-202ENST00000446868 3311 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ADCYAP1R1-207ENST00000614107 6575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 LYRM1-203ENST00000412082 1399 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ADK-205ENST00000539909 1866 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PTBP1-221ENST00000635647 3691 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 TLK1-202ENST00000360843 5726 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DDX49-214ENST00000629999 1912 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 NT5C3A-213ENST00000610140 1670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 RAB37-216ENST00000613645 1653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 INF2-209ENST00000617571 2956 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 HARS-202ENST00000415192 1401 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 AC130686.1-201ENST00000622936 2466 ntBASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 DNER-201ENST00000341772 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 CTNND2-202ENST00000458100 1962 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ARHGEF17-201ENST00000263674 7853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 PHTF1-203ENST00000369600 3075 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.07
PPARGP37231 ELF3-202ENST00000367283 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.5 ms