Protein–RNA interactions for Protein: P31276

HOXC13, Homeobox protein Hox-C13, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC13P31276 ACTG1P17-202ENST00000560958 1662 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SLC6A2-205ENST00000566163 1759 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 DDC-213ENST00000617822 1809 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CC2D1B-202ENST00000371586 5642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 GNRH2-204ENST00000380347 758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 Z69890.1-201ENST00000382990 339 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RLN3-201ENST00000431365 580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MRPL22P1-201ENST00000505398 616 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TMCO5B-205ENST00000530020 894 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AC005696.1-201ENST00000572876 443 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ADGRE3-204ENST00000595472 486 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CCT7-201ENST00000258091 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AL357054.3-201ENST00000607084 2055 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 EFHC1-230ENST00000637263 2089 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ODF2L-204ENST00000370566 2155 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ETV4-202ENST00000393664 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SEPT9-208ENST00000541152 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TOX3-201ENST00000219746 3233 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RASGRF1-203ENST00000558480 6237 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LIN9-201ENST00000328205 3567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 DEF8-210ENST00000563594 4450 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 PNPLA3-201ENST00000216180 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 VRK3-217ENST00000599538 2126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ZNF256-201ENST00000282308 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 PSMB10-201ENST00000358514 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MAGOH-202ENST00000371470 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MIR557-201ENST00000385239 98 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 UBE2I-206ENST00000403747 1217 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 NUBP1-202ENST00000433392 1185 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LINC00441-201ENST00000433480 1143 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HOXC13P31276 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HOXC13P31276 SRSF3-208ENST00000620941 869 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
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HOXC13P31276 TAGLN3-201ENST00000273368 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MRGPRX4-201ENST00000314254 1444 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 ENO3-202ENST00000518175 1448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 AC007952.5-201ENST00000572818 1486 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 LACTB2-201ENST00000276590 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 KRT8P24-201ENST00000560290 1559 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 RSPH6A-203ENST00000600188 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SIRT2-202ENST00000358931 1912 ntTSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 CALCB-203ENST00000533448 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SLC6A12-207ENST00000536824 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 SLC34A2-203ENST00000504570 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 EPB41L3-201ENST00000341928 4706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
HOXC13P31276 TFDP1-201ENST00000375370 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
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