Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PAPD7-207ENST00000631941 1902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PRC1-204ENST00000442656 2060 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FEZF1-AS1-202ENST00000428449 2653 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SELENOV-202ENST00000423711 1701 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 STK33-203ENST00000396672 2558 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PAK3-208ENST00000446737 2550 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PLEKHB2-206ENST00000409612 2210 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC004754.1-201ENST00000600536 2242 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 OPN1SW-201ENST00000249389 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 IFNLR1-204ENST00000374419 953 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MPP6-202ENST00000396475 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL513211.1-201ENST00000429053 483 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RPSAP12-201ENST00000435879 888 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PLSCR1-202ENST00000448787 996 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 RN7SL351P-201ENST00000469306 248 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 POLR3G-207ENST00000514483 682 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AP000866.5-201ENST00000531241 445 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC079949.1-201ENST00000541419 505 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC078814.4-201ENST00000546650 327 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 NR4A1-209ENST00000548232 1101 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LINC01082-201ENST00000601250 441 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MIAT_exon5_3.1-201ENST00000613656 377 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PPHLN1-223ENST00000610488 1521 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ATF4-203ENST00000404241 1910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FCRL1-207ENST00000491942 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TPPP3-205ENST00000564104 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ERLIN1-202ENST00000407654 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ENO2-211ENST00000541477 2549 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SFXN4-201ENST00000355697 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SUGP2-202ENST00000337018 3640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LGALS4-201ENST00000307751 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 MAPT-206ENST00000415613 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PARP16-201ENST00000261888 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 FLAD1-202ENST00000295530 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 U3.5-201ENST00000363448 216 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 COLEC11-204ENST00000402794 1134 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LINC00483-202ENST00000419688 558 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GOLGA6L16P-201ENST00000441780 1299 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 BX072579.1-201ENST00000449453 344 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GULOP-201ENST00000454030 748 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC008443.1-202ENST00000506340 687 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC025171.3-201ENST00000509036 472 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 EXTL3-AS1-203ENST00000520023 780 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LINC00824-204ENST00000520766 597 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC113133.1-201ENST00000522388 1088 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 C9orf135-205ENST00000527647 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC139099.2-201ENST00000572343 641 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PTOV1-AS2-203ENST00000601893 719 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AL031280.1-201ENST00000436991 2224 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC062028.1-201ENST00000536743 1422 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 OLFML3-203ENST00000393300 1961 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 DNAJB13-201ENST00000339764 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PPARG-205ENST00000397010 2017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LINC00479-201ENST00000412102 2033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SALL2-205ENST00000611430 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 CR382285.1-201ENST00000625012 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 LDLR-202ENST00000455727 2333 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 NICN1-201ENST00000273598 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 KCTD6-205ENST00000490264 1759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 AC113367.3-201ENST00000508316 1912 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 TMPRSS2-201ENST00000332149 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 PPP1R32-201ENST00000338608 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SURF4-208ENST00000613129 3148 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
HOXA10P31260 SEMA4D-204ENST00000420101 1837 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 100.7 ms