Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

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Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 AL590556.2-202ENST00000636906 844 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 RCOR2-201ENST00000301459 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 HGSNAT-207ENST00000521576 2332 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 DDC-204ENST00000426377 1700 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 FTSJ1-203ENST00000396894 1669 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 KRT37-201ENST00000225550 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 OSCP1-201ENST00000235532 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 OSCP1-203ENST00000356637 1463 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 NAAA-203ENST00000505594 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 PMM1-201ENST00000216259 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 SAA1-202ENST00000405158 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 POLR2LP1-206ENST00000444785 187 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 RN7SL838P-201ENST00000481676 295 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AC022113.2-201ENST00000504935 704 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AL512356.1-201ENST00000548203 535 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 MIR6893-201ENST00000613458 69 ntBASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 LINC00969-253ENST00000625338 804 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 GSTT2-203ENST00000634759 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 GNPNAT1-203ENST00000554230 2238 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PTPRGP23470 GSN-209ENST00000449733 2702 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 GPI-205ENST00000586425 1799 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NXPH3-202ENST00000513748 1530 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC025171.1-202ENST00000499871 2271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SERHL2-201ENST00000327678 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC026786.1-201ENST00000540096 1374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 PCDHA5-202ENST00000529859 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 PDCD6-201ENST00000264933 1135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 HSD3BP1-201ENST00000286193 1111 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 OR2W3-201ENST00000360358 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 KRTAP1-5-201ENST00000361883 1177 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 UCN3-201ENST00000380433 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC011995.2-201ENST00000452701 574 ntTSL 4 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 KCNC4-AS1-201ENST00000455967 748 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AL445363.2-201ENST00000554608 837 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SULT1A3-206ENST00000563322 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SULT1A4-204ENST00000565290 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC084262.1-201ENST00000567818 751 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 BIRC5-211ENST00000592734 386 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AC007292.1-201ENST00000594444 746 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
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PTPRGP23470 AL445363.1-201ENST00000623749 952 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 LINC00969-322ENST00000630170 584 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AL590094.1-208ENST00000636917 627 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 HNRNPLL-212ENST00000608859 3035 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 YPEL4-201ENST00000300022 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 PLPPR1-201ENST00000374874 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 HLA-DMB-258ENST00000418107 1397 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 ACVR1C-201ENST00000243349 8994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 CSRP2-201ENST00000311083 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NR1I3-201ENST00000367979 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NR1I3-207ENST00000367985 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 DPPA5-201ENST00000370370 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 MRPL55-219ENST00000391867 685 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 CASP8-206ENST00000392258 1060 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 RPL18AP15-201ENST00000430258 517 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AL359182.1-201ENST00000435915 469 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 HLA-W-207ENST00000439514 771 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 NR1I3-225ENST00000508387 634 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 OR52V1P-201ENST00000515557 898 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 IGHVII-74-1-201ENST00000517572 241 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 CSRP2-203ENST00000547435 632 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
PTPRGP23470 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
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