Protein–RNA interactions for Protein: P19474

TRIM21, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM21, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 475 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM21P19474 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MSC-AS1-204ENST00000518916 864 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SP6-202ENST00000536300 3848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TUBB6-210ENST00000590967 430 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CARMIL2-202ENST00000545661 4119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 POLN-210ENST00000511885 3253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RGS8-204ENST00000483095 1432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RNF167-201ENST00000262482 1915 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 KCNH6-202ENST00000456941 2928 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CEP70-201ENST00000264982 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRKCSH-212ENST00000591462 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 VAPA-202ENST00000400000 6815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 NUTM2G-201ENST00000354649 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LINC01185-202ENST00000452343 1705 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 NR1H3-221ENST00000481889 1704 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 INTS14-201ENST00000313182 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF77-201ENST00000314531 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LMNA-213ENST00000473598 2015 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ST3GAL5-203ENST00000393805 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TAF6-205ENST00000437822 2318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LINC01305-201ENST00000420866 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SCAMP5-202ENST00000425597 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC022028.2-201ENST00000474115 2619 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CACNA1G-230ENST00000514717 6699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ITGB4-203ENST00000450894 5645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FAM86B1-203ENST00000448228 2096 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SGK1-205ENST00000413996 2686 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 APLP2-203ENST00000338167 3270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RRAGD-201ENST00000359203 4042 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC4A5-201ENST00000346834 6233 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DBNDD2-201ENST00000357275 1036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PLTP-203ENST00000372431 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SIRT5-203ENST00000379262 2339 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC007405.2-202ENST00000418106 540 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 TRIT1-214ENST00000537440 2026 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC091891.1-201ENST00000560688 688 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 BX088702.1-201ENST00000610784 235 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 OR10AC1-201ENST00000439431 2898 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PROSER3-202ENST00000396908 2149 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 IGF2BP1-201ENST00000290341 8274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 CCSER2-203ENST00000372088 7657 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MAN2B2-202ENST00000504248 2968 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SNAP91-215ENST00000521743 4263 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AC105206.1-202ENST00000314927 2368 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 RMDN1-201ENST00000406452 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL122018.1-201ENST00000446607 2310 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FGF1-201ENST00000337706 1469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SYT12-201ENST00000393946 4534 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ATCAY-201ENST00000450849 5070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 SELENON-202ENST00000361547 4334 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZNF362-201ENST00000373428 2936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZFYVE27-202ENST00000357540 2765 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ZFYVE27-204ENST00000370610 2769 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LRSAM1-204ENST00000373324 3044 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 MIR1202-201ENST00000408529 83 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
TRIM21P19474 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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