Protein–RNA interactions for Protein: P18031

PTPN1, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 435 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN1P18031 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RN7SL258P-201ENST00000478664 300 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC008723.1-201ENST00000506922 207 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LINC02380-201ENST00000510956 1038 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PAGE3-202ENST00000519203 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC129507.4-201ENST00000570501 411 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 FBXL12-212ENST00000592067 879 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ZNF350-AS1-202ENST00000600253 577 ntTSL 4 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC079336.7-201ENST00000623428 1078 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MBD3L2B-201ENST00000636986 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 WSCD1-202ENST00000539421 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 FETUB-207ENST00000450521 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 YIPF3-213ENST00000506469 1444 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 CLN8-204ENST00000519254 1769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 HYOU1-218ENST00000614668 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PLCXD2-204ENST00000477665 1721 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 UBE2A-202ENST00000371558 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 GGT1-202ENST00000400380 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SLC38A6-201ENST00000267488 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ACTL8-202ENST00000617065 1670 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 DCUN1D3-201ENST00000324344 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PIP4K2A-201ENST00000323883 1319 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ARAP1-203ENST00000393605 4778 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PIGT-203ENST00000372689 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MTMR9-202ENST00000526292 1960 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 CEP78-203ENST00000376598 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ZNF34-201ENST00000343459 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ZNF34-202ENST00000429371 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PTGES3-207ENST00000614328 2077 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 FOLR1-202ENST00000393676 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AL606491.1-201ENST00000412797 483 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC127070.2-201ENST00000424075 555 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PTPA-217ENST00000434095 870 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AL592301.1-201ENST00000439501 864 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC040162.4-201ENST00000574912 1185 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC012044.1-201ENST00000603431 297 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 CDK7-214ENST00000626796 358 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 CDK7-215ENST00000629350 1149 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LGALS12-202ENST00000340246 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RET-202ENST00000355710 5659 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RFTN1-203ENST00000432519 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PEX5L-215ENST00000485199 2992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 EPN2-210ENST00000571254 1883 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 FES-202ENST00000394300 2302 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SLC11A2-204ENST00000541174 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SEZ6-201ENST00000317338 4471 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LRRK1-201ENST00000388948 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 UNC5A-201ENST00000329542 3812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 POLR3K-201ENST00000293860 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 VASH2-204ENST00000366966 1369 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 BRMS1-202ENST00000425825 1363 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 BRD7P5-201ENST00000299197 1822 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TMEM143-201ENST00000293261 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 ZDHHC3-201ENST00000296127 3101 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TAF9-202ENST00000328663 1461 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TMEM38A-201ENST00000187762 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SC5D-201ENST00000264027 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AMOTL2-201ENST00000249883 4488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 DKK4-201ENST00000220812 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 MRPL32-201ENST00000223324 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 SSBP1-201ENST00000265304 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 LINC01388-201ENST00000416242 416 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
PTPN1P18031 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.6 ms