Protein–RNA interactions for Protein: P13164

IFITM1, Interferon-induced transmembrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 125 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IFITM1P13164 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TJAP1-202ENST00000372444 2778 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TJAP1-203ENST00000372445 2751 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 INTS6L-201ENST00000370752 3793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ALPL-206ENST00000539907 2241 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CCDC148-201ENST00000283233 3122 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 LILRB1-203ENST00000396317 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MARK2-206ENST00000425897 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ANKS1B-208ENST00000547010 2595 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TEX35-204ENST00000367642 2452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CICP7-201ENST00000432723 2477 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ZNF654-204ENST00000636215 6446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ASAH2B-202ENST00000374007 3715 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ACTA1-202ENST00000366684 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SYNPR-209ENST00000478300 2709 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 P3H2-201ENST00000319332 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MLF1-217ENST00000619577 2290 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 FAM95B1-212ENST00000592873 4692 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GRIP2-205ENST00000621039 7752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TMPRSS13-201ENST00000430170 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 VPS13A-205ENST00000376636 11145 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TRGV9-201ENST00000444775 1735 ntAPPRIS P1 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MYLIP-201ENST00000349606 2796 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SNX14-201ENST00000314673 3486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 PLGRKT-201ENST00000223864 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 PRDX5-202ENST00000347941 463 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AC004975.2-201ENST00000442017 565 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SPTB-203ENST00000389721 6705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 NRP2-202ENST00000357118 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SCARA5-202ENST00000380385 2934 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GLB1L-202ENST00000392089 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 BCL2L13-202ENST00000337612 4905 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 LINC01623-201ENST00000440244 2458 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GREB1-201ENST00000234142 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 IPO7-201ENST00000379719 6191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AL356966.1-201ENST00000454752 2367 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 BIN3-205ENST00000519513 1431 ntTSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 DLG1-AS1-202ENST00000430666 1694 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SERINC5-202ENST00000507668 6479 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 GRIP2-206ENST00000637182 3727 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TRMT2B-206ENST00000545398 3106 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 MIEF2-201ENST00000323019 3364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ABCA8-208ENST00000586539 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AGGF1P10-201ENST00000635005 2191 ntBASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AL031708.1-201ENST00000454337 5326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ENO2-201ENST00000229277 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.8□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 NLRP2-204ENST00000391721 3420 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 APLP2-202ENST00000278756 3687 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 UBP1-204ENST00000447368 3669 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 PPFIA4-201ENST00000272198 5045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SARDH-204ENST00000371872 3344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SPACA9-202ENST00000356311 2243 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 TRHDE-AS1-202ENST00000435350 2966 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 BCL2-201ENST00000333681 3209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SFPQ-201ENST00000357214 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 ADAMTS10-211ENST00000597188 3749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 RNASEH1-201ENST00000315212 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CYP2J2-201ENST00000371204 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SLC6A9-205ENST00000372310 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 CTRC-201ENST00000375943 3147 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 EXTL2-207ENST00000535414 3146 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SRSF1-205ENST00000582730 3117 ntTSL 2 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 HAUS6-202ENST00000380502 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 OPRK1-201ENST00000265572 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 EPB41L5-205ENST00000452780 6410 ntTSL 5 BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 SAP18-201ENST00000382533 2298 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 AC126564.1-201ENST00000623628 2013 ntBASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 RAPGEF6-207ENST00000507093 5742 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
IFITM1P13164 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.79□□□□□ -0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.9 ms