Protein–RNA interactions for Protein: P0C875

FAM228B, Protein FAM228B, humanhuman

Predictions only

Length 321 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228BP0C875 CHRND-206ENST00000543200 2918 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ZNF541-203ENST00000391901 4580 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MAPK12-203ENST00000395780 1459 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SCD5-202ENST00000319540 3101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC26A6-213ENST00000455886 2460 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CASP6-202ENST00000352981 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LRRFIP2-202ENST00000354379 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PPHLN1-206ENST00000395580 1693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GNAS-213ENST00000371099 3709 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SDR16C5-202ENST00000396721 2399 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NR3C1-201ENST00000231509 3556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CPN1-201ENST00000370418 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PHLDB1-223ENST00000600882 5479 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 KRBA2-202ENST00000396267 2562 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MARS-201ENST00000262027 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MIR497HG-202ENST00000572453 3838 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PDE2A-206ENST00000444035 4193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GDAP1L1-208ENST00000617075 2645 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DNMT3B-204ENST00000353855 4237 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TMEM173-201ENST00000330794 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TNNI1-201ENST00000336092 1750 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LRP10-203ENST00000546834 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CPNE2-204ENST00000565874 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 EXT1-201ENST00000378204 8270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FER1L4-204ENST00000430275 3281 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MYMK-201ENST00000339996 818 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 HOXB-AS1-201ENST00000435312 806 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LILRA5-204ENST00000486742 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DUX4L46-201ENST00000566845 751 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LGALS12-204ENST00000415491 1816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ASF1A-201ENST00000229595 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 APOB-202ENST00000399256 3128 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 POPDC2-201ENST00000264231 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 HBP1-212ENST00000485846 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 FAM219A-203ENST00000379080 3591 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LINC01792-201ENST00000452787 2050 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PPT1-203ENST00000433473 2267 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NDFIP2-205ENST00000612570 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 DIP2A-201ENST00000400274 7023 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SCNN1A-201ENST00000228916 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MYH16-204ENST00000452010 1599 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PRAME-205ENST00000405655 2179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LIMK1-208ENST00000538333 2170 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 VPS9D1-202ENST00000561976 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 BIRC2-208ENST00000532672 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PITPNM3-201ENST00000262483 7086 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CCT2-201ENST00000299300 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 MIER1-209ENST00000401042 1648 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NTM-205ENST00000425719 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GPR88-201ENST00000315033 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ATRN-202ENST00000446916 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LARP7-202ENST00000344442 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 GTF3C2-214ENST00000622534 1858 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC019294.4-201ENST00000561777 2905 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SNX19-213ENST00000534726 1656 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 LAP3P2-201ENST00000454686 1454 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 NLRP2B-201ENST00000434992 3194 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 CBFA2T3-202ENST00000327483 4033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 U82695.1-202ENST00000428676 700 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SFTPC-202ENST00000437090 773 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 TSPEAR-AS1-202ENST00000451035 2108 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AC097103.2-201ENST00000504670 602 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 ASNA1-205ENST00000611688 1214 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SARM1-208ENST00000585482 10309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 SCNN1A-215ENST00000540037 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
FAM228BP0C875 PDIA3P1-201ENST00000471856 1510 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 91.2 ms