Protein–RNA interactions for Protein: P09105

HBQ1, Hemoglobin subunit theta-1, humanhuman

Predictions only

Length 142 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HBQ1P09105 DTX3-202ENST00000548198 3199 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 MSR1-201ENST00000262101 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 PCCB-215ENST00000482086 1436 ntTSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CCDC197-206ENST00000640978 1429 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 RSPO3-201ENST00000356698 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 NDUFC2-201ENST00000281031 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 KMT2E-202ENST00000311117 6874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 NCR3-202ENST00000376071 541 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 AC092506.1-202ENST00000401022 528 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 IGHVIII-5-2-201ENST00000522505 261 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 AC009065.3-201ENST00000562027 627 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 MIR3188-201ENST00000583494 85 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 HCG18-245ENST00000602550 559 ntTSL 4 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 HIST1H4A-201ENST00000617569 312 ntAPPRIS P1 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 AL353726.2-201ENST00000623259 884 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 STK26-204ENST00000481105 1835 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 UGT3A2-201ENST00000282507 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ADI1-201ENST00000327435 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 LOXL3-202ENST00000393937 2398 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 SNX14-203ENST00000369627 3111 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 JARID2-202ENST00000397311 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ZW10-201ENST00000200135 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 NEK2-201ENST00000366998 1865 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 MAP3K12-205ENST00000547488 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 TMBIM7P-202ENST00000641474 1516 ntBASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 DNASE1L1-206ENST00000393638 2665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CUX1-215ENST00000556210 4044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 LINC00841-201ENST00000451929 2126 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 PHKG1-210ENST00000537360 2139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 BCAR3-210ENST00000539242 2114 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ARRDC4-201ENST00000268042 4072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 BCAR1-205ENST00000420641 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 RIMS1-216ENST00000521978 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 SOCS2-205ENST00000548537 3733 ntTSL 2 BASIC13.84□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 FBLN2-203ENST00000404922 4318 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CKMT1B-201ENST00000300283 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CKMT1A-204ENST00000434505 1779 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 RNF166-210ENST00000568683 1768 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CNN2-201ENST00000263097 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 CNN2-205ENST00000562958 2194 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 RAB18-207ENST00000535776 4811 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 FBRS-201ENST00000287468 2811 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.19
HBQ1P09105 ARHGEF3-212ENST00000495373 2024 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 C1QTNF9-201ENST00000332018 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 SNRPN-203ENST00000400097 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC015688.4-201ENST00000580780 1647 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 SVOPL-201ENST00000288513 1413 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 ATP13A2-202ENST00000341676 3681 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 IKBKB-217ENST00000520810 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GABRA1-201ENST00000023897 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 YTHDF2-201ENST00000373812 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 MINDY2-203ENST00000559228 9238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 KRT8P19-201ENST00000551916 1455 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 MLXIPL-205ENST00000429400 3173 ntTSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 CRB3-201ENST00000308243 631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 KRTAP2-4-201ENST00000394015 764 ntAPPRIS P1 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AL672291.1-201ENST00000417047 462 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AL009181.1-201ENST00000418471 1085 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GAS5-209ENST00000430245 723 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC093627.5-203ENST00000497320 746 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 NDUFC2-204ENST00000528164 561 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 CHMP4BP1-201ENST00000556017 588 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC027237.1-201ENST00000560942 655 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC010754.1-201ENST00000582300 1061 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 ZNF772-207ENST00000601768 482 ntTSL 3 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC022001.2-201ENST00000607849 580 ntTSL 2 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AL353770.1-201ENST00000614915 403 ntBASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 ROPN1-211ENST00000620893 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 AC004706.3-207ENST00000634823 977 ntTSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 GRID2IP-203ENST00000457091 3636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 PLA2G16-201ENST00000323646 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
HBQ1P09105 MAOB-201ENST00000378069 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.83□□□□□ -0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms